Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc169Q8BXX9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc169Q8BXX9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc169Q8BXX9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc169Q8BXX9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc169Q8BXX9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc169Q8BXX9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc169Q8BXX9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc169Q8BXX9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc169Q8BXX9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc169Q8BXX9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc169Q8BXX9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc169Q8BXX9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc169Q8BXX9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc169Q8BXX9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc169Q8BXX9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc169Q8BXX9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc169Q8BXX9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc169Q8BXX9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc169Q8BXX9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc169Q8BXX9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc169Q8BXX9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc169Q8BXX9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc169Q8BXX9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc169Q8BXX9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc169Q8BXX9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc169Q8BXX9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc169Q8BXX9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc169Q8BXX9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc169Q8BXX9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc169Q8BXX9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc169Q8BXX9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc169Q8BXX9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc169Q8BXX9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc169Q8BXX9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc169Q8BXX9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc169Q8BXX9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc169Q8BXX9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc169Q8BXX9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc169Q8BXX9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc169Q8BXX9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc169Q8BXX9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc169Q8BXX9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc169Q8BXX9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc169Q8BXX9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc169Q8BXX9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc169Q8BXX9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc169Q8BXX9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc169Q8BXX9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc169Q8BXX9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc169Q8BXX9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc169Q8BXX9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc169Q8BXX9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc169Q8BXX9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc169Q8BXX9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc169Q8BXX9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc169Q8BXX9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc169Q8BXX9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc169Q8BXX9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc169Q8BXX9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc169Q8BXX9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc169Q8BXX9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc169Q8BXX9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc169Q8BXX9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc169Q8BXX9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc169Q8BXX9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc169Q8BXX9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc169Q8BXX9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc169Q8BXX9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc169Q8BXX9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc169Q8BXX9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc169Q8BXX9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc169Q8BXX9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc169Q8BXX9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc169Q8BXX9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc169Q8BXX9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc169Q8BXX9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc169Q8BXX9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc169Q8BXX9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc169Q8BXX9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc169Q8BXX9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc169Q8BXX9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc169Q8BXX9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc169Q8BXX9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc169Q8BXX9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc169Q8BXX9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc169Q8BXX9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc169Q8BXX9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc169Q8BXX9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc169Q8BXX9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc169Q8BXX9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc169Q8BXX9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc169Q8BXX9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc169Q8BXX9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc169Q8BXX9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc169Q8BXX9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc169Q8BXX9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc169Q8BXX9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc169Q8BXX9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc169Q8BXX9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms