Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Iffo1Q8BXL9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Iffo1Q8BXL9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Iffo1Q8BXL9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Iffo1Q8BXL9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Iffo1Q8BXL9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Iffo1Q8BXL9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Iffo1Q8BXL9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Iffo1Q8BXL9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Iffo1Q8BXL9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Iffo1Q8BXL9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Iffo1Q8BXL9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Iffo1Q8BXL9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Iffo1Q8BXL9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Iffo1Q8BXL9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Iffo1Q8BXL9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Iffo1Q8BXL9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Iffo1Q8BXL9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Iffo1Q8BXL9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Iffo1Q8BXL9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Iffo1Q8BXL9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Iffo1Q8BXL9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Iffo1Q8BXL9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Iffo1Q8BXL9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Iffo1Q8BXL9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Iffo1Q8BXL9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Iffo1Q8BXL9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Iffo1Q8BXL9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Iffo1Q8BXL9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Iffo1Q8BXL9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Iffo1Q8BXL9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Iffo1Q8BXL9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Iffo1Q8BXL9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Iffo1Q8BXL9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Iffo1Q8BXL9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Iffo1Q8BXL9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Iffo1Q8BXL9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Iffo1Q8BXL9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Iffo1Q8BXL9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Iffo1Q8BXL9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Iffo1Q8BXL9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Iffo1Q8BXL9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Iffo1Q8BXL9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Iffo1Q8BXL9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Iffo1Q8BXL9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Iffo1Q8BXL9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Iffo1Q8BXL9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Iffo1Q8BXL9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Iffo1Q8BXL9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Iffo1Q8BXL9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Iffo1Q8BXL9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Iffo1Q8BXL9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Iffo1Q8BXL9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Iffo1Q8BXL9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Iffo1Q8BXL9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Iffo1Q8BXL9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Iffo1Q8BXL9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Iffo1Q8BXL9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Iffo1Q8BXL9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Iffo1Q8BXL9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Iffo1Q8BXL9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Iffo1Q8BXL9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Iffo1Q8BXL9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Iffo1Q8BXL9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Iffo1Q8BXL9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Iffo1Q8BXL9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Iffo1Q8BXL9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Iffo1Q8BXL9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Iffo1Q8BXL9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Iffo1Q8BXL9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Iffo1Q8BXL9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms