Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTF7

Lig4, DNA ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig4Q8BTF7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lig4Q8BTF7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lig4Q8BTF7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lig4Q8BTF7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lig4Q8BTF7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lig4Q8BTF7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lig4Q8BTF7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lig4Q8BTF7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lig4Q8BTF7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lig4Q8BTF7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lig4Q8BTF7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Lig4Q8BTF7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lig4Q8BTF7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lig4Q8BTF7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lig4Q8BTF7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lig4Q8BTF7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lig4Q8BTF7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Lig4Q8BTF7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lig4Q8BTF7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lig4Q8BTF7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Lig4Q8BTF7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lig4Q8BTF7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Lig4Q8BTF7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lig4Q8BTF7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lig4Q8BTF7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lig4Q8BTF7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lig4Q8BTF7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lig4Q8BTF7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lig4Q8BTF7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lig4Q8BTF7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lig4Q8BTF7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Lig4Q8BTF7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lig4Q8BTF7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lig4Q8BTF7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lig4Q8BTF7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lig4Q8BTF7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lig4Q8BTF7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lig4Q8BTF7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lig4Q8BTF7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lig4Q8BTF7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lig4Q8BTF7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lig4Q8BTF7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lig4Q8BTF7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lig4Q8BTF7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lig4Q8BTF7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lig4Q8BTF7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lig4Q8BTF7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lig4Q8BTF7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lig4Q8BTF7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lig4Q8BTF7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lig4Q8BTF7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lig4Q8BTF7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lig4Q8BTF7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lig4Q8BTF7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lig4Q8BTF7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lig4Q8BTF7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lig4Q8BTF7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lig4Q8BTF7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lig4Q8BTF7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lig4Q8BTF7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lig4Q8BTF7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lig4Q8BTF7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lig4Q8BTF7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lig4Q8BTF7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lig4Q8BTF7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lig4Q8BTF7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lig4Q8BTF7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lig4Q8BTF7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lig4Q8BTF7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lig4Q8BTF7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lig4Q8BTF7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lig4Q8BTF7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lig4Q8BTF7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lig4Q8BTF7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lig4Q8BTF7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lig4Q8BTF7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lig4Q8BTF7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lig4Q8BTF7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lig4Q8BTF7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lig4Q8BTF7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lig4Q8BTF7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lig4Q8BTF7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lig4Q8BTF7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lig4Q8BTF7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lig4Q8BTF7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lig4Q8BTF7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lig4Q8BTF7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lig4Q8BTF7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lig4Q8BTF7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lig4Q8BTF7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lig4Q8BTF7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lig4Q8BTF7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lig4Q8BTF7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lig4Q8BTF7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lig4Q8BTF7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lig4Q8BTF7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lig4Q8BTF7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lig4Q8BTF7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Lig4Q8BTF7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lig4Q8BTF7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms