Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSZ2

Ap3s2, AP-3 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s2Q8BSZ2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
Ap3s2Q8BSZ2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
Ap3s2Q8BSZ2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
Ap3s2Q8BSZ2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
Ap3s2Q8BSZ2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Ap3s2Q8BSZ2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Ap3s2Q8BSZ2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Ap3s2Q8BSZ2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Ap3s2Q8BSZ2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Ap3s2Q8BSZ2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
Ap3s2Q8BSZ2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
Ap3s2Q8BSZ2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
Ap3s2Q8BSZ2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,15■□□□□ 0,82
Ap3s2Q8BSZ2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,82
Ap3s2Q8BSZ2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,82
Ap3s2Q8BSZ2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20,14■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20,14■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20,14■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20,14■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20,13■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20,13■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,12■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20,12■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,11■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,11■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20,1■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,09■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,08■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20,08■□□□□ 0,81
Ap3s2Q8BSZ2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,07■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,03■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,03■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20,02■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
Ap3s2Q8BSZ2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,01■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19,99■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19,99■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,99■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,98■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19,97■□□□□ 0,79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29,1 ms