Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRM2

Gorab, RAB6-interacting golgin, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GorabQ8BRM2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GorabQ8BRM2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GorabQ8BRM2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GorabQ8BRM2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GorabQ8BRM2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GorabQ8BRM2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GorabQ8BRM2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
GorabQ8BRM2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms