Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckap4Q8BMK4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ckap4Q8BMK4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ckap4Q8BMK4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ckap4Q8BMK4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ckap4Q8BMK4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ckap4Q8BMK4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ckap4Q8BMK4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ckap4Q8BMK4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ckap4Q8BMK4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ckap4Q8BMK4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ckap4Q8BMK4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ckap4Q8BMK4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ckap4Q8BMK4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ckap4Q8BMK4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ckap4Q8BMK4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ckap4Q8BMK4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap4Q8BMK4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ckap4Q8BMK4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ckap4Q8BMK4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ckap4Q8BMK4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ckap4Q8BMK4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ckap4Q8BMK4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ckap4Q8BMK4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ckap4Q8BMK4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ckap4Q8BMK4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap4Q8BMK4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap4Q8BMK4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap4Q8BMK4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap4Q8BMK4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap4Q8BMK4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap4Q8BMK4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap4Q8BMK4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap4Q8BMK4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap4Q8BMK4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap4Q8BMK4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap4Q8BMK4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap4Q8BMK4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ckap4Q8BMK4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ckap4Q8BMK4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ckap4Q8BMK4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ckap4Q8BMK4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ckap4Q8BMK4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ckap4Q8BMK4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ckap4Q8BMK4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ckap4Q8BMK4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ckap4Q8BMK4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ckap4Q8BMK4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ckap4Q8BMK4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ckap4Q8BMK4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ckap4Q8BMK4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap4Q8BMK4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap4Q8BMK4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap4Q8BMK4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap4Q8BMK4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap4Q8BMK4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap4Q8BMK4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ckap4Q8BMK4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ckap4Q8BMK4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ckap4Q8BMK4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ckap4Q8BMK4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ckap4Q8BMK4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ckap4Q8BMK4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ckap4Q8BMK4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap4Q8BMK4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap4Q8BMK4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap4Q8BMK4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap4Q8BMK4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ckap4Q8BMK4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ckap4Q8BMK4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms