Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMJ7

Cgrrf1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cgrrf1Q8BMJ7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cgrrf1Q8BMJ7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cgrrf1Q8BMJ7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cgrrf1Q8BMJ7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cgrrf1Q8BMJ7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cgrrf1Q8BMJ7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cgrrf1Q8BMJ7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cgrrf1Q8BMJ7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cgrrf1Q8BMJ7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cgrrf1Q8BMJ7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cgrrf1Q8BMJ7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cgrrf1Q8BMJ7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cgrrf1Q8BMJ7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cgrrf1Q8BMJ7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cgrrf1Q8BMJ7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cgrrf1Q8BMJ7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cgrrf1Q8BMJ7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cgrrf1Q8BMJ7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cgrrf1Q8BMJ7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cgrrf1Q8BMJ7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cgrrf1Q8BMJ7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cgrrf1Q8BMJ7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cgrrf1Q8BMJ7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cgrrf1Q8BMJ7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cgrrf1Q8BMJ7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cgrrf1Q8BMJ7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cgrrf1Q8BMJ7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cgrrf1Q8BMJ7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cgrrf1Q8BMJ7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cgrrf1Q8BMJ7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cgrrf1Q8BMJ7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cgrrf1Q8BMJ7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cgrrf1Q8BMJ7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cgrrf1Q8BMJ7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cgrrf1Q8BMJ7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cgrrf1Q8BMJ7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cgrrf1Q8BMJ7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cgrrf1Q8BMJ7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cgrrf1Q8BMJ7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cgrrf1Q8BMJ7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cgrrf1Q8BMJ7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cgrrf1Q8BMJ7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cgrrf1Q8BMJ7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cgrrf1Q8BMJ7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cgrrf1Q8BMJ7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cgrrf1Q8BMJ7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cgrrf1Q8BMJ7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cgrrf1Q8BMJ7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cgrrf1Q8BMJ7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cgrrf1Q8BMJ7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cgrrf1Q8BMJ7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cgrrf1Q8BMJ7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cgrrf1Q8BMJ7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cgrrf1Q8BMJ7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cgrrf1Q8BMJ7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cgrrf1Q8BMJ7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cgrrf1Q8BMJ7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cgrrf1Q8BMJ7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cgrrf1Q8BMJ7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cgrrf1Q8BMJ7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cgrrf1Q8BMJ7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cgrrf1Q8BMJ7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cgrrf1Q8BMJ7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cgrrf1Q8BMJ7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cgrrf1Q8BMJ7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cgrrf1Q8BMJ7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cgrrf1Q8BMJ7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cgrrf1Q8BMJ7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cgrrf1Q8BMJ7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cgrrf1Q8BMJ7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cgrrf1Q8BMJ7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cgrrf1Q8BMJ7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cgrrf1Q8BMJ7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cgrrf1Q8BMJ7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cgrrf1Q8BMJ7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cgrrf1Q8BMJ7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cgrrf1Q8BMJ7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cgrrf1Q8BMJ7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cgrrf1Q8BMJ7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cgrrf1Q8BMJ7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cgrrf1Q8BMJ7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cgrrf1Q8BMJ7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cgrrf1Q8BMJ7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cgrrf1Q8BMJ7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cgrrf1Q8BMJ7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cgrrf1Q8BMJ7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cgrrf1Q8BMJ7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cgrrf1Q8BMJ7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cgrrf1Q8BMJ7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cgrrf1Q8BMJ7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cgrrf1Q8BMJ7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cgrrf1Q8BMJ7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms