Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf18Q8BM39 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf18Q8BM39 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf18Q8BM39 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf18Q8BM39 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf18Q8BM39 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf18Q8BM39 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf18Q8BM39 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf18Q8BM39 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf18Q8BM39 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf18Q8BM39 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf18Q8BM39 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf18Q8BM39 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf18Q8BM39 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf18Q8BM39 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf18Q8BM39 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf18Q8BM39 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf18Q8BM39 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf18Q8BM39 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf18Q8BM39 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf18Q8BM39 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf18Q8BM39 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf18Q8BM39 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf18Q8BM39 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf18Q8BM39 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf18Q8BM39 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf18Q8BM39 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf18Q8BM39 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf18Q8BM39 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf18Q8BM39 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf18Q8BM39 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf18Q8BM39 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf18Q8BM39 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf18Q8BM39 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf18Q8BM39 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf18Q8BM39 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf18Q8BM39 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf18Q8BM39 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf18Q8BM39 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf18Q8BM39 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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