Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJA2

Slc41a1, Solute carrier family 41 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc41a1Q8BJA2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc41a1Q8BJA2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc41a1Q8BJA2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc41a1Q8BJA2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc41a1Q8BJA2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc41a1Q8BJA2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc41a1Q8BJA2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc41a1Q8BJA2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc41a1Q8BJA2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc41a1Q8BJA2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc41a1Q8BJA2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc41a1Q8BJA2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc41a1Q8BJA2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc41a1Q8BJA2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc41a1Q8BJA2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc41a1Q8BJA2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc41a1Q8BJA2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc41a1Q8BJA2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc41a1Q8BJA2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc41a1Q8BJA2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc41a1Q8BJA2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc41a1Q8BJA2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc41a1Q8BJA2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc41a1Q8BJA2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc41a1Q8BJA2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc41a1Q8BJA2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc41a1Q8BJA2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc41a1Q8BJA2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc41a1Q8BJA2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc41a1Q8BJA2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc41a1Q8BJA2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc41a1Q8BJA2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc41a1Q8BJA2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc41a1Q8BJA2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc41a1Q8BJA2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc41a1Q8BJA2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc41a1Q8BJA2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc41a1Q8BJA2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc41a1Q8BJA2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc41a1Q8BJA2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc41a1Q8BJA2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc41a1Q8BJA2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc41a1Q8BJA2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc41a1Q8BJA2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc41a1Q8BJA2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc41a1Q8BJA2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc41a1Q8BJA2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc41a1Q8BJA2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc41a1Q8BJA2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc41a1Q8BJA2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc41a1Q8BJA2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc41a1Q8BJA2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc41a1Q8BJA2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc41a1Q8BJA2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc41a1Q8BJA2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc41a1Q8BJA2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc41a1Q8BJA2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc41a1Q8BJA2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc41a1Q8BJA2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc41a1Q8BJA2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc41a1Q8BJA2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc41a1Q8BJA2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc41a1Q8BJA2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc41a1Q8BJA2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc41a1Q8BJA2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc41a1Q8BJA2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc41a1Q8BJA2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc41a1Q8BJA2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc41a1Q8BJA2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc41a1Q8BJA2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc41a1Q8BJA2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc41a1Q8BJA2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc41a1Q8BJA2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc41a1Q8BJA2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc41a1Q8BJA2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc41a1Q8BJA2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc41a1Q8BJA2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc41a1Q8BJA2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc41a1Q8BJA2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc41a1Q8BJA2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc41a1Q8BJA2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc41a1Q8BJA2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc41a1Q8BJA2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc41a1Q8BJA2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc41a1Q8BJA2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc41a1Q8BJA2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc41a1Q8BJA2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc41a1Q8BJA2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc41a1Q8BJA2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc41a1Q8BJA2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc41a1Q8BJA2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc41a1Q8BJA2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc41a1Q8BJA2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc41a1Q8BJA2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc41a1Q8BJA2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc41a1Q8BJA2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc41a1Q8BJA2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc41a1Q8BJA2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc41a1Q8BJA2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc41a1Q8BJA2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.6 ms