Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tnpo1Q8BFY9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tnpo1Q8BFY9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tnpo1Q8BFY9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Tnpo1Q8BFY9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tnpo1Q8BFY9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Tnpo1Q8BFY9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tnpo1Q8BFY9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tnpo1Q8BFY9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tnpo1Q8BFY9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tnpo1Q8BFY9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tnpo1Q8BFY9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tnpo1Q8BFY9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tnpo1Q8BFY9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnpo1Q8BFY9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnpo1Q8BFY9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnpo1Q8BFY9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnpo1Q8BFY9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnpo1Q8BFY9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnpo1Q8BFY9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnpo1Q8BFY9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnpo1Q8BFY9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnpo1Q8BFY9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnpo1Q8BFY9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnpo1Q8BFY9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnpo1Q8BFY9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnpo1Q8BFY9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnpo1Q8BFY9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnpo1Q8BFY9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnpo1Q8BFY9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tnpo1Q8BFY9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tnpo1Q8BFY9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tnpo1Q8BFY9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnpo1Q8BFY9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnpo1Q8BFY9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnpo1Q8BFY9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnpo1Q8BFY9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnpo1Q8BFY9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tnpo1Q8BFY9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnpo1Q8BFY9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnpo1Q8BFY9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnpo1Q8BFY9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnpo1Q8BFY9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnpo1Q8BFY9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnpo1Q8BFY9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnpo1Q8BFY9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnpo1Q8BFY9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnpo1Q8BFY9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tnpo1Q8BFY9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tnpo1Q8BFY9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tnpo1Q8BFY9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tnpo1Q8BFY9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tnpo1Q8BFY9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnpo1Q8BFY9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnpo1Q8BFY9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnpo1Q8BFY9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnpo1Q8BFY9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnpo1Q8BFY9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnpo1Q8BFY9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnpo1Q8BFY9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnpo1Q8BFY9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnpo1Q8BFY9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnpo1Q8BFY9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnpo1Q8BFY9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnpo1Q8BFY9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnpo1Q8BFY9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnpo1Q8BFY9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnpo1Q8BFY9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnpo1Q8BFY9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tnpo1Q8BFY9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tnpo1Q8BFY9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tnpo1Q8BFY9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tnpo1Q8BFY9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnpo1Q8BFY9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnpo1Q8BFY9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnpo1Q8BFY9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnpo1Q8BFY9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnpo1Q8BFY9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tnpo1Q8BFY9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tnpo1Q8BFY9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tnpo1Q8BFY9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tnpo1Q8BFY9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnpo1Q8BFY9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnpo1Q8BFY9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnpo1Q8BFY9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnpo1Q8BFY9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnpo1Q8BFY9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnpo1Q8BFY9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnpo1Q8BFY9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnpo1Q8BFY9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnpo1Q8BFY9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnpo1Q8BFY9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnpo1Q8BFY9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tnpo1Q8BFY9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tnpo1Q8BFY9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tnpo1Q8BFY9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tnpo1Q8BFY9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Tnpo1Q8BFY9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tnpo1Q8BFY9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tnpo1Q8BFY9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms