Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFV3

Dusp4, Dual specificity protein phosphatase 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp4Q8BFV3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dusp4Q8BFV3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dusp4Q8BFV3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dusp4Q8BFV3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dusp4Q8BFV3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dusp4Q8BFV3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Dusp4Q8BFV3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Dusp4Q8BFV3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dusp4Q8BFV3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dusp4Q8BFV3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Dusp4Q8BFV3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dusp4Q8BFV3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dusp4Q8BFV3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dusp4Q8BFV3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dusp4Q8BFV3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dusp4Q8BFV3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dusp4Q8BFV3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dusp4Q8BFV3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dusp4Q8BFV3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dusp4Q8BFV3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dusp4Q8BFV3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dusp4Q8BFV3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Dusp4Q8BFV3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dusp4Q8BFV3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dusp4Q8BFV3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dusp4Q8BFV3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Dusp4Q8BFV3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dusp4Q8BFV3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dusp4Q8BFV3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Dusp4Q8BFV3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Dusp4Q8BFV3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dusp4Q8BFV3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dusp4Q8BFV3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dusp4Q8BFV3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dusp4Q8BFV3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dusp4Q8BFV3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dusp4Q8BFV3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dusp4Q8BFV3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dusp4Q8BFV3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dusp4Q8BFV3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dusp4Q8BFV3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dusp4Q8BFV3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dusp4Q8BFV3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dusp4Q8BFV3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dusp4Q8BFV3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Dusp4Q8BFV3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dusp4Q8BFV3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dusp4Q8BFV3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dusp4Q8BFV3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dusp4Q8BFV3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dusp4Q8BFV3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dusp4Q8BFV3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dusp4Q8BFV3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dusp4Q8BFV3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dusp4Q8BFV3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dusp4Q8BFV3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dusp4Q8BFV3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dusp4Q8BFV3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dusp4Q8BFV3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dusp4Q8BFV3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Dusp4Q8BFV3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Dusp4Q8BFV3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dusp4Q8BFV3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dusp4Q8BFV3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Dusp4Q8BFV3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dusp4Q8BFV3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dusp4Q8BFV3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dusp4Q8BFV3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dusp4Q8BFV3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dusp4Q8BFV3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Dusp4Q8BFV3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Dusp4Q8BFV3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dusp4Q8BFV3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Dusp4Q8BFV3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dusp4Q8BFV3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dusp4Q8BFV3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dusp4Q8BFV3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Dusp4Q8BFV3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dusp4Q8BFV3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dusp4Q8BFV3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dusp4Q8BFV3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dusp4Q8BFV3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dusp4Q8BFV3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Dusp4Q8BFV3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dusp4Q8BFV3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dusp4Q8BFV3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dusp4Q8BFV3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Dusp4Q8BFV3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dusp4Q8BFV3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dusp4Q8BFV3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dusp4Q8BFV3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dusp4Q8BFV3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dusp4Q8BFV3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dusp4Q8BFV3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dusp4Q8BFV3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dusp4Q8BFV3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dusp4Q8BFV3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dusp4Q8BFV3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Dusp4Q8BFV3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dusp4Q8BFV3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms