Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChfrQ810L3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChfrQ810L3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChfrQ810L3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChfrQ810L3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChfrQ810L3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChfrQ810L3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChfrQ810L3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChfrQ810L3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChfrQ810L3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChfrQ810L3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms