Protein–RNA interactions for Protein: Q810I2

Trim50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim50Q810I2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim50Q810I2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim50Q810I2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim50Q810I2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim50Q810I2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim50Q810I2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim50Q810I2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim50Q810I2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim50Q810I2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim50Q810I2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim50Q810I2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim50Q810I2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim50Q810I2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim50Q810I2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim50Q810I2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim50Q810I2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim50Q810I2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim50Q810I2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim50Q810I2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim50Q810I2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim50Q810I2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim50Q810I2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim50Q810I2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim50Q810I2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim50Q810I2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim50Q810I2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim50Q810I2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim50Q810I2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim50Q810I2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim50Q810I2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim50Q810I2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim50Q810I2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim50Q810I2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim50Q810I2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim50Q810I2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim50Q810I2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim50Q810I2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim50Q810I2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim50Q810I2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim50Q810I2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim50Q810I2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim50Q810I2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim50Q810I2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim50Q810I2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim50Q810I2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim50Q810I2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim50Q810I2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim50Q810I2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim50Q810I2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim50Q810I2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim50Q810I2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim50Q810I2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim50Q810I2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim50Q810I2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim50Q810I2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim50Q810I2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim50Q810I2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim50Q810I2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim50Q810I2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim50Q810I2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim50Q810I2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim50Q810I2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim50Q810I2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim50Q810I2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim50Q810I2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim50Q810I2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim50Q810I2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim50Q810I2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim50Q810I2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim50Q810I2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim50Q810I2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim50Q810I2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim50Q810I2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim50Q810I2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms