Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZP0

4930503B20Rik, 4930503B20Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930503B20RikQ80ZP0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930503B20RikQ80ZP0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930503B20RikQ80ZP0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930503B20RikQ80ZP0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930503B20RikQ80ZP0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930503B20RikQ80ZP0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930503B20RikQ80ZP0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930503B20RikQ80ZP0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930503B20RikQ80ZP0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930503B20RikQ80ZP0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930503B20RikQ80ZP0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930503B20RikQ80ZP0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930503B20RikQ80ZP0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930503B20RikQ80ZP0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930503B20RikQ80ZP0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930503B20RikQ80ZP0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930503B20RikQ80ZP0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930503B20RikQ80ZP0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
4930503B20RikQ80ZP0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930503B20RikQ80ZP0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930503B20RikQ80ZP0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930503B20RikQ80ZP0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930503B20RikQ80ZP0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930503B20RikQ80ZP0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930503B20RikQ80ZP0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930503B20RikQ80ZP0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930503B20RikQ80ZP0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930503B20RikQ80ZP0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930503B20RikQ80ZP0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930503B20RikQ80ZP0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930503B20RikQ80ZP0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930503B20RikQ80ZP0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930503B20RikQ80ZP0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930503B20RikQ80ZP0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930503B20RikQ80ZP0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930503B20RikQ80ZP0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930503B20RikQ80ZP0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930503B20RikQ80ZP0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930503B20RikQ80ZP0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930503B20RikQ80ZP0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930503B20RikQ80ZP0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930503B20RikQ80ZP0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930503B20RikQ80ZP0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930503B20RikQ80ZP0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930503B20RikQ80ZP0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930503B20RikQ80ZP0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
4930503B20RikQ80ZP0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930503B20RikQ80ZP0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930503B20RikQ80ZP0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930503B20RikQ80ZP0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
4930503B20RikQ80ZP0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930503B20RikQ80ZP0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
4930503B20RikQ80ZP0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930503B20RikQ80ZP0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930503B20RikQ80ZP0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930503B20RikQ80ZP0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930503B20RikQ80ZP0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930503B20RikQ80ZP0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930503B20RikQ80ZP0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
4930503B20RikQ80ZP0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930503B20RikQ80ZP0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930503B20RikQ80ZP0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930503B20RikQ80ZP0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930503B20RikQ80ZP0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930503B20RikQ80ZP0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930503B20RikQ80ZP0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930503B20RikQ80ZP0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930503B20RikQ80ZP0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930503B20RikQ80ZP0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930503B20RikQ80ZP0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930503B20RikQ80ZP0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930503B20RikQ80ZP0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930503B20RikQ80ZP0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930503B20RikQ80ZP0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930503B20RikQ80ZP0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930503B20RikQ80ZP0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4930503B20RikQ80ZP0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930503B20RikQ80ZP0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930503B20RikQ80ZP0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930503B20RikQ80ZP0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930503B20RikQ80ZP0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930503B20RikQ80ZP0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930503B20RikQ80ZP0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930503B20RikQ80ZP0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930503B20RikQ80ZP0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930503B20RikQ80ZP0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930503B20RikQ80ZP0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930503B20RikQ80ZP0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930503B20RikQ80ZP0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930503B20RikQ80ZP0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930503B20RikQ80ZP0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930503B20RikQ80ZP0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930503B20RikQ80ZP0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930503B20RikQ80ZP0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930503B20RikQ80ZP0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930503B20RikQ80ZP0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930503B20RikQ80ZP0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930503B20RikQ80ZP0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930503B20RikQ80ZP0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930503B20RikQ80ZP0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms