Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cracr2bQ80ZJ8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cracr2bQ80ZJ8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cracr2bQ80ZJ8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cracr2bQ80ZJ8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cracr2bQ80ZJ8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cracr2bQ80ZJ8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cracr2bQ80ZJ8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cracr2bQ80ZJ8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cracr2bQ80ZJ8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cracr2bQ80ZJ8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cracr2bQ80ZJ8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Cracr2bQ80ZJ8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cracr2bQ80ZJ8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Cracr2bQ80ZJ8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cracr2bQ80ZJ8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cracr2bQ80ZJ8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cracr2bQ80ZJ8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cracr2bQ80ZJ8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cracr2bQ80ZJ8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cracr2bQ80ZJ8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cracr2bQ80ZJ8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cracr2bQ80ZJ8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cracr2bQ80ZJ8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cracr2bQ80ZJ8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cracr2bQ80ZJ8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cracr2bQ80ZJ8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cracr2bQ80ZJ8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cracr2bQ80ZJ8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cracr2bQ80ZJ8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cracr2bQ80ZJ8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cracr2bQ80ZJ8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cracr2bQ80ZJ8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cracr2bQ80ZJ8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cracr2bQ80ZJ8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cracr2bQ80ZJ8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cracr2bQ80ZJ8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cracr2bQ80ZJ8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cracr2bQ80ZJ8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cracr2bQ80ZJ8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cracr2bQ80ZJ8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cracr2bQ80ZJ8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cracr2bQ80ZJ8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cracr2bQ80ZJ8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cracr2bQ80ZJ8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cracr2bQ80ZJ8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cracr2bQ80ZJ8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cracr2bQ80ZJ8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cracr2bQ80ZJ8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cracr2bQ80ZJ8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cracr2bQ80ZJ8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cracr2bQ80ZJ8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cracr2bQ80ZJ8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cracr2bQ80ZJ8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cracr2bQ80ZJ8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cracr2bQ80ZJ8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cracr2bQ80ZJ8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cracr2bQ80ZJ8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cracr2bQ80ZJ8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cracr2bQ80ZJ8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cracr2bQ80ZJ8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cracr2bQ80ZJ8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cracr2bQ80ZJ8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cracr2bQ80ZJ8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cracr2bQ80ZJ8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Cracr2bQ80ZJ8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cracr2bQ80ZJ8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cracr2bQ80ZJ8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cracr2bQ80ZJ8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cracr2bQ80ZJ8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cracr2bQ80ZJ8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cracr2bQ80ZJ8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cracr2bQ80ZJ8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cracr2bQ80ZJ8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cracr2bQ80ZJ8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cracr2bQ80ZJ8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cracr2bQ80ZJ8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cracr2bQ80ZJ8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cracr2bQ80ZJ8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cracr2bQ80ZJ8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cracr2bQ80ZJ8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cracr2bQ80ZJ8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cracr2bQ80ZJ8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cracr2bQ80ZJ8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cracr2bQ80ZJ8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cracr2bQ80ZJ8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cracr2bQ80ZJ8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cracr2bQ80ZJ8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms