Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Alkbh8Q80Y20 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Alkbh8Q80Y20 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Alkbh8Q80Y20 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Alkbh8Q80Y20 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Alkbh8Q80Y20 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Alkbh8Q80Y20 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Alkbh8Q80Y20 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Alkbh8Q80Y20 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alkbh8Q80Y20 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alkbh8Q80Y20 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Alkbh8Q80Y20 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Alkbh8Q80Y20 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alkbh8Q80Y20 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Alkbh8Q80Y20 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Alkbh8Q80Y20 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Alkbh8Q80Y20 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Alkbh8Q80Y20 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Alkbh8Q80Y20 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Alkbh8Q80Y20 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Alkbh8Q80Y20 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Alkbh8Q80Y20 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Alkbh8Q80Y20 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Alkbh8Q80Y20 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alkbh8Q80Y20 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alkbh8Q80Y20 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Alkbh8Q80Y20 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Alkbh8Q80Y20 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alkbh8Q80Y20 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alkbh8Q80Y20 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alkbh8Q80Y20 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alkbh8Q80Y20 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Alkbh8Q80Y20 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alkbh8Q80Y20 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alkbh8Q80Y20 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alkbh8Q80Y20 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alkbh8Q80Y20 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alkbh8Q80Y20 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alkbh8Q80Y20 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Alkbh8Q80Y20 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Alkbh8Q80Y20 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Alkbh8Q80Y20 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Alkbh8Q80Y20 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Alkbh8Q80Y20 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alkbh8Q80Y20 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alkbh8Q80Y20 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alkbh8Q80Y20 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alkbh8Q80Y20 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alkbh8Q80Y20 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alkbh8Q80Y20 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alkbh8Q80Y20 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alkbh8Q80Y20 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alkbh8Q80Y20 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alkbh8Q80Y20 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alkbh8Q80Y20 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alkbh8Q80Y20 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alkbh8Q80Y20 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alkbh8Q80Y20 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alkbh8Q80Y20 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Alkbh8Q80Y20 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Alkbh8Q80Y20 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Alkbh8Q80Y20 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Alkbh8Q80Y20 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Alkbh8Q80Y20 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alkbh8Q80Y20 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Alkbh8Q80Y20 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Alkbh8Q80Y20 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alkbh8Q80Y20 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alkbh8Q80Y20 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alkbh8Q80Y20 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alkbh8Q80Y20 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alkbh8Q80Y20 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alkbh8Q80Y20 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alkbh8Q80Y20 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alkbh8Q80Y20 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alkbh8Q80Y20 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alkbh8Q80Y20 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alkbh8Q80Y20 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alkbh8Q80Y20 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alkbh8Q80Y20 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alkbh8Q80Y20 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Alkbh8Q80Y20 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Alkbh8Q80Y20 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Alkbh8Q80Y20 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Alkbh8Q80Y20 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alkbh8Q80Y20 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Alkbh8Q80Y20 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alkbh8Q80Y20 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alkbh8Q80Y20 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alkbh8Q80Y20 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Alkbh8Q80Y20 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alkbh8Q80Y20 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alkbh8Q80Y20 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alkbh8Q80Y20 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alkbh8Q80Y20 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alkbh8Q80Y20 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alkbh8Q80Y20 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alkbh8Q80Y20 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Alkbh8Q80Y20 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alkbh8Q80Y20 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms