Protein–RNA interactions for Protein: Q80WV7

Srrm3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm3Q80WV7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srrm3Q80WV7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srrm3Q80WV7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srrm3Q80WV7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srrm3Q80WV7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srrm3Q80WV7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srrm3Q80WV7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srrm3Q80WV7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srrm3Q80WV7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srrm3Q80WV7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Srrm3Q80WV7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Srrm3Q80WV7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srrm3Q80WV7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Srrm3Q80WV7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Srrm3Q80WV7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srrm3Q80WV7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srrm3Q80WV7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srrm3Q80WV7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srrm3Q80WV7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srrm3Q80WV7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srrm3Q80WV7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srrm3Q80WV7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srrm3Q80WV7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srrm3Q80WV7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srrm3Q80WV7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srrm3Q80WV7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srrm3Q80WV7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srrm3Q80WV7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srrm3Q80WV7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srrm3Q80WV7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srrm3Q80WV7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srrm3Q80WV7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srrm3Q80WV7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srrm3Q80WV7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srrm3Q80WV7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srrm3Q80WV7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srrm3Q80WV7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srrm3Q80WV7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srrm3Q80WV7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srrm3Q80WV7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srrm3Q80WV7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srrm3Q80WV7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srrm3Q80WV7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Srrm3Q80WV7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Srrm3Q80WV7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srrm3Q80WV7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srrm3Q80WV7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srrm3Q80WV7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srrm3Q80WV7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srrm3Q80WV7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srrm3Q80WV7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srrm3Q80WV7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srrm3Q80WV7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srrm3Q80WV7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srrm3Q80WV7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srrm3Q80WV7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srrm3Q80WV7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srrm3Q80WV7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srrm3Q80WV7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srrm3Q80WV7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srrm3Q80WV7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srrm3Q80WV7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srrm3Q80WV7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srrm3Q80WV7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srrm3Q80WV7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srrm3Q80WV7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srrm3Q80WV7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srrm3Q80WV7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srrm3Q80WV7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Srrm3Q80WV7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms