Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp8Q80U87 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp8Q80U87 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp8Q80U87 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp8Q80U87 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp8Q80U87 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp8Q80U87 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp8Q80U87 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp8Q80U87 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp8Q80U87 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp8Q80U87 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp8Q80U87 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp8Q80U87 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp8Q80U87 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp8Q80U87 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp8Q80U87 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp8Q80U87 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp8Q80U87 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp8Q80U87 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp8Q80U87 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp8Q80U87 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp8Q80U87 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp8Q80U87 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp8Q80U87 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp8Q80U87 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp8Q80U87 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp8Q80U87 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp8Q80U87 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp8Q80U87 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp8Q80U87 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp8Q80U87 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp8Q80U87 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp8Q80U87 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp8Q80U87 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp8Q80U87 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp8Q80U87 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp8Q80U87 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp8Q80U87 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp8Q80U87 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp8Q80U87 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp8Q80U87 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp8Q80U87 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp8Q80U87 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp8Q80U87 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Usp8Q80U87 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp8Q80U87 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp8Q80U87 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp8Q80U87 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp8Q80U87 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp8Q80U87 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp8Q80U87 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp8Q80U87 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp8Q80U87 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp8Q80U87 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp8Q80U87 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp8Q80U87 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp8Q80U87 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp8Q80U87 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp8Q80U87 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp8Q80U87 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp8Q80U87 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp8Q80U87 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp8Q80U87 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp8Q80U87 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp8Q80U87 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp8Q80U87 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp8Q80U87 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp8Q80U87 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp8Q80U87 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp8Q80U87 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp8Q80U87 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp8Q80U87 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp8Q80U87 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp8Q80U87 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp8Q80U87 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp8Q80U87 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp8Q80U87 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp8Q80U87 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp8Q80U87 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp8Q80U87 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp8Q80U87 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp8Q80U87 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp8Q80U87 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp8Q80U87 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp8Q80U87 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp8Q80U87 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp8Q80U87 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp8Q80U87 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.1 ms