Protein–RNA interactions for Protein: Q80ST9

Lca5, Lebercilin, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lca5Q80ST9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Lca5Q80ST9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lca5Q80ST9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lca5Q80ST9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Lca5Q80ST9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lca5Q80ST9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lca5Q80ST9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lca5Q80ST9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lca5Q80ST9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lca5Q80ST9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lca5Q80ST9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lca5Q80ST9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Lca5Q80ST9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Lca5Q80ST9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lca5Q80ST9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lca5Q80ST9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lca5Q80ST9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lca5Q80ST9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lca5Q80ST9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lca5Q80ST9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lca5Q80ST9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lca5Q80ST9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lca5Q80ST9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lca5Q80ST9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lca5Q80ST9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Lca5Q80ST9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lca5Q80ST9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lca5Q80ST9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lca5Q80ST9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lca5Q80ST9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lca5Q80ST9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lca5Q80ST9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lca5Q80ST9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Lca5Q80ST9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lca5Q80ST9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lca5Q80ST9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lca5Q80ST9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Lca5Q80ST9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lca5Q80ST9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lca5Q80ST9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lca5Q80ST9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lca5Q80ST9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lca5Q80ST9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lca5Q80ST9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lca5Q80ST9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lca5Q80ST9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lca5Q80ST9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lca5Q80ST9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lca5Q80ST9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lca5Q80ST9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lca5Q80ST9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lca5Q80ST9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lca5Q80ST9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Lca5Q80ST9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Lca5Q80ST9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lca5Q80ST9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lca5Q80ST9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Lca5Q80ST9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lca5Q80ST9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lca5Q80ST9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lca5Q80ST9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lca5Q80ST9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lca5Q80ST9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lca5Q80ST9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lca5Q80ST9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lca5Q80ST9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lca5Q80ST9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lca5Q80ST9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lca5Q80ST9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lca5Q80ST9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Lca5Q80ST9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lca5Q80ST9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lca5Q80ST9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lca5Q80ST9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lca5Q80ST9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lca5Q80ST9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lca5Q80ST9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lca5Q80ST9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lca5Q80ST9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lca5Q80ST9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lca5Q80ST9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lca5Q80ST9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lca5Q80ST9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Lca5Q80ST9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lca5Q80ST9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lca5Q80ST9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lca5Q80ST9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lca5Q80ST9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lca5Q80ST9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lca5Q80ST9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lca5Q80ST9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lca5Q80ST9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lca5Q80ST9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lca5Q80ST9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lca5Q80ST9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lca5Q80ST9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Lca5Q80ST9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lca5Q80ST9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lca5Q80ST9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lca5Q80ST9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms