Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK1

Rfx4, Transcription factor RFX4, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx4Q7TNK1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx4Q7TNK1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx4Q7TNK1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx4Q7TNK1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx4Q7TNK1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx4Q7TNK1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx4Q7TNK1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx4Q7TNK1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx4Q7TNK1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx4Q7TNK1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx4Q7TNK1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx4Q7TNK1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx4Q7TNK1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rfx4Q7TNK1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rfx4Q7TNK1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx4Q7TNK1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx4Q7TNK1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx4Q7TNK1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx4Q7TNK1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx4Q7TNK1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx4Q7TNK1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx4Q7TNK1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx4Q7TNK1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx4Q7TNK1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx4Q7TNK1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx4Q7TNK1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx4Q7TNK1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx4Q7TNK1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx4Q7TNK1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx4Q7TNK1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx4Q7TNK1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx4Q7TNK1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx4Q7TNK1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx4Q7TNK1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx4Q7TNK1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx4Q7TNK1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx4Q7TNK1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx4Q7TNK1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx4Q7TNK1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx4Q7TNK1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx4Q7TNK1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx4Q7TNK1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx4Q7TNK1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx4Q7TNK1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx4Q7TNK1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx4Q7TNK1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx4Q7TNK1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx4Q7TNK1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx4Q7TNK1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx4Q7TNK1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx4Q7TNK1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx4Q7TNK1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx4Q7TNK1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx4Q7TNK1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx4Q7TNK1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx4Q7TNK1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx4Q7TNK1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx4Q7TNK1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx4Q7TNK1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx4Q7TNK1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx4Q7TNK1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx4Q7TNK1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx4Q7TNK1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rfx4Q7TNK1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx4Q7TNK1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx4Q7TNK1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx4Q7TNK1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx4Q7TNK1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx4Q7TNK1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx4Q7TNK1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx4Q7TNK1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms