Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf139Q7TMV1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf139Q7TMV1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf139Q7TMV1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf139Q7TMV1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf139Q7TMV1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf139Q7TMV1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf139Q7TMV1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf139Q7TMV1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf139Q7TMV1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf139Q7TMV1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf139Q7TMV1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rnf139Q7TMV1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf139Q7TMV1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf139Q7TMV1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf139Q7TMV1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf139Q7TMV1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf139Q7TMV1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf139Q7TMV1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf139Q7TMV1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf139Q7TMV1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf139Q7TMV1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf139Q7TMV1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf139Q7TMV1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf139Q7TMV1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf139Q7TMV1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf139Q7TMV1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf139Q7TMV1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf139Q7TMV1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf139Q7TMV1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf139Q7TMV1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf139Q7TMV1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf139Q7TMV1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf139Q7TMV1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf139Q7TMV1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf139Q7TMV1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf139Q7TMV1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf139Q7TMV1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf139Q7TMV1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf139Q7TMV1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf139Q7TMV1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf139Q7TMV1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf139Q7TMV1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf139Q7TMV1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf139Q7TMV1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf139Q7TMV1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf139Q7TMV1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf139Q7TMV1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf139Q7TMV1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf139Q7TMV1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf139Q7TMV1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf139Q7TMV1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf139Q7TMV1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf139Q7TMV1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf139Q7TMV1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf139Q7TMV1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf139Q7TMV1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf139Q7TMV1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf139Q7TMV1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf139Q7TMV1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf139Q7TMV1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf139Q7TMV1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf139Q7TMV1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf139Q7TMV1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf139Q7TMV1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf139Q7TMV1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf139Q7TMV1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf139Q7TMV1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf139Q7TMV1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf139Q7TMV1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf139Q7TMV1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf139Q7TMV1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf139Q7TMV1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf139Q7TMV1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf139Q7TMV1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf139Q7TMV1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf139Q7TMV1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf139Q7TMV1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf139Q7TMV1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf139Q7TMV1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf139Q7TMV1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf139Q7TMV1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf139Q7TMV1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf139Q7TMV1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf139Q7TMV1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf139Q7TMV1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf139Q7TMV1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf139Q7TMV1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf139Q7TMV1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf139Q7TMV1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf139Q7TMV1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf139Q7TMV1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf139Q7TMV1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf139Q7TMV1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf139Q7TMV1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf139Q7TMV1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf139Q7TMV1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf139Q7TMV1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf139Q7TMV1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf139Q7TMV1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms