Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Uhrf2Q7TMI3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Uhrf2Q7TMI3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Uhrf2Q7TMI3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Uhrf2Q7TMI3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Uhrf2Q7TMI3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Uhrf2Q7TMI3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Uhrf2Q7TMI3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Uhrf2Q7TMI3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uhrf2Q7TMI3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uhrf2Q7TMI3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uhrf2Q7TMI3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uhrf2Q7TMI3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uhrf2Q7TMI3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uhrf2Q7TMI3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uhrf2Q7TMI3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uhrf2Q7TMI3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uhrf2Q7TMI3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uhrf2Q7TMI3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uhrf2Q7TMI3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Uhrf2Q7TMI3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf2Q7TMI3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf2Q7TMI3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf2Q7TMI3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf2Q7TMI3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf2Q7TMI3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf2Q7TMI3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf2Q7TMI3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uhrf2Q7TMI3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Uhrf2Q7TMI3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uhrf2Q7TMI3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uhrf2Q7TMI3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Uhrf2Q7TMI3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uhrf2Q7TMI3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uhrf2Q7TMI3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uhrf2Q7TMI3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uhrf2Q7TMI3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uhrf2Q7TMI3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uhrf2Q7TMI3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uhrf2Q7TMI3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uhrf2Q7TMI3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uhrf2Q7TMI3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Uhrf2Q7TMI3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uhrf2Q7TMI3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uhrf2Q7TMI3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uhrf2Q7TMI3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uhrf2Q7TMI3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uhrf2Q7TMI3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uhrf2Q7TMI3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uhrf2Q7TMI3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uhrf2Q7TMI3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uhrf2Q7TMI3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uhrf2Q7TMI3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uhrf2Q7TMI3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uhrf2Q7TMI3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uhrf2Q7TMI3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uhrf2Q7TMI3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uhrf2Q7TMI3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf2Q7TMI3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf2Q7TMI3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf2Q7TMI3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf2Q7TMI3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf2Q7TMI3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf2Q7TMI3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf2Q7TMI3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf2Q7TMI3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf2Q7TMI3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf2Q7TMI3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms