Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nemp1Q6ZQE4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nemp1Q6ZQE4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nemp1Q6ZQE4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nemp1Q6ZQE4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nemp1Q6ZQE4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nemp1Q6ZQE4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nemp1Q6ZQE4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nemp1Q6ZQE4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nemp1Q6ZQE4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nemp1Q6ZQE4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nemp1Q6ZQE4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nemp1Q6ZQE4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nemp1Q6ZQE4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nemp1Q6ZQE4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nemp1Q6ZQE4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nemp1Q6ZQE4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nemp1Q6ZQE4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nemp1Q6ZQE4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nemp1Q6ZQE4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nemp1Q6ZQE4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nemp1Q6ZQE4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nemp1Q6ZQE4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nemp1Q6ZQE4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nemp1Q6ZQE4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nemp1Q6ZQE4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nemp1Q6ZQE4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nemp1Q6ZQE4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nemp1Q6ZQE4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nemp1Q6ZQE4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nemp1Q6ZQE4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nemp1Q6ZQE4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nemp1Q6ZQE4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nemp1Q6ZQE4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nemp1Q6ZQE4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nemp1Q6ZQE4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nemp1Q6ZQE4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nemp1Q6ZQE4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nemp1Q6ZQE4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nemp1Q6ZQE4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nemp1Q6ZQE4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nemp1Q6ZQE4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nemp1Q6ZQE4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nemp1Q6ZQE4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nemp1Q6ZQE4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nemp1Q6ZQE4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nemp1Q6ZQE4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nemp1Q6ZQE4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nemp1Q6ZQE4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nemp1Q6ZQE4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nemp1Q6ZQE4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nemp1Q6ZQE4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nemp1Q6ZQE4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nemp1Q6ZQE4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nemp1Q6ZQE4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nemp1Q6ZQE4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nemp1Q6ZQE4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nemp1Q6ZQE4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nemp1Q6ZQE4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nemp1Q6ZQE4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nemp1Q6ZQE4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nemp1Q6ZQE4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nemp1Q6ZQE4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nemp1Q6ZQE4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nemp1Q6ZQE4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nemp1Q6ZQE4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nemp1Q6ZQE4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms