Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Efr3bQ6ZQ18 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Efr3bQ6ZQ18 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efr3bQ6ZQ18 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efr3bQ6ZQ18 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efr3bQ6ZQ18 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efr3bQ6ZQ18 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efr3bQ6ZQ18 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efr3bQ6ZQ18 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efr3bQ6ZQ18 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efr3bQ6ZQ18 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efr3bQ6ZQ18 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Efr3bQ6ZQ18 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efr3bQ6ZQ18 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efr3bQ6ZQ18 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Efr3bQ6ZQ18 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Efr3bQ6ZQ18 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Efr3bQ6ZQ18 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Efr3bQ6ZQ18 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Efr3bQ6ZQ18 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Efr3bQ6ZQ18 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Efr3bQ6ZQ18 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Efr3bQ6ZQ18 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Efr3bQ6ZQ18 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Efr3bQ6ZQ18 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Efr3bQ6ZQ18 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Efr3bQ6ZQ18 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Efr3bQ6ZQ18 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Efr3bQ6ZQ18 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Efr3bQ6ZQ18 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Efr3bQ6ZQ18 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Efr3bQ6ZQ18 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Efr3bQ6ZQ18 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Efr3bQ6ZQ18 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Efr3bQ6ZQ18 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Efr3bQ6ZQ18 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Efr3bQ6ZQ18 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Efr3bQ6ZQ18 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Efr3bQ6ZQ18 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Efr3bQ6ZQ18 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Efr3bQ6ZQ18 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Efr3bQ6ZQ18 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Efr3bQ6ZQ18 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Efr3bQ6ZQ18 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Efr3bQ6ZQ18 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Efr3bQ6ZQ18 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Efr3bQ6ZQ18 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Efr3bQ6ZQ18 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Efr3bQ6ZQ18 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Efr3bQ6ZQ18 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Efr3bQ6ZQ18 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Efr3bQ6ZQ18 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Efr3bQ6ZQ18 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Efr3bQ6ZQ18 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Efr3bQ6ZQ18 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Efr3bQ6ZQ18 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Efr3bQ6ZQ18 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Efr3bQ6ZQ18 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Efr3bQ6ZQ18 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Efr3bQ6ZQ18 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Efr3bQ6ZQ18 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Efr3bQ6ZQ18 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Efr3bQ6ZQ18 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Efr3bQ6ZQ18 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Efr3bQ6ZQ18 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Efr3bQ6ZQ18 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Efr3bQ6ZQ18 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Efr3bQ6ZQ18 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Efr3bQ6ZQ18 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Efr3bQ6ZQ18 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Efr3bQ6ZQ18 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Efr3bQ6ZQ18 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Efr3bQ6ZQ18 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Efr3bQ6ZQ18 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Efr3bQ6ZQ18 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Efr3bQ6ZQ18 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Efr3bQ6ZQ18 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Efr3bQ6ZQ18 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Efr3bQ6ZQ18 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Efr3bQ6ZQ18 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Efr3bQ6ZQ18 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Efr3bQ6ZQ18 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Efr3bQ6ZQ18 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Efr3bQ6ZQ18 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Efr3bQ6ZQ18 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Efr3bQ6ZQ18 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Efr3bQ6ZQ18 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Efr3bQ6ZQ18 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efr3bQ6ZQ18 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efr3bQ6ZQ18 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Efr3bQ6ZQ18 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efr3bQ6ZQ18 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efr3bQ6ZQ18 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efr3bQ6ZQ18 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efr3bQ6ZQ18 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efr3bQ6ZQ18 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efr3bQ6ZQ18 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Efr3bQ6ZQ18 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efr3bQ6ZQ18 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efr3bQ6ZQ18 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1218.8 ms