Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc154Q6RUT8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc154Q6RUT8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc154Q6RUT8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc154Q6RUT8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc154Q6RUT8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc154Q6RUT8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc154Q6RUT8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc154Q6RUT8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc154Q6RUT8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc154Q6RUT8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc154Q6RUT8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc154Q6RUT8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc154Q6RUT8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc154Q6RUT8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc154Q6RUT8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc154Q6RUT8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc154Q6RUT8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc154Q6RUT8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc154Q6RUT8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc154Q6RUT8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc154Q6RUT8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc154Q6RUT8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc154Q6RUT8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc154Q6RUT8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc154Q6RUT8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc154Q6RUT8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc154Q6RUT8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc154Q6RUT8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc154Q6RUT8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc154Q6RUT8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc154Q6RUT8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc154Q6RUT8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc154Q6RUT8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc154Q6RUT8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc154Q6RUT8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc154Q6RUT8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc154Q6RUT8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc154Q6RUT8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc154Q6RUT8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc154Q6RUT8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc154Q6RUT8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc154Q6RUT8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc154Q6RUT8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc154Q6RUT8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc154Q6RUT8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc154Q6RUT8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc154Q6RUT8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc154Q6RUT8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc154Q6RUT8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc154Q6RUT8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc154Q6RUT8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc154Q6RUT8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc154Q6RUT8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc154Q6RUT8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc154Q6RUT8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc154Q6RUT8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc154Q6RUT8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc154Q6RUT8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc154Q6RUT8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc154Q6RUT8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc154Q6RUT8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc154Q6RUT8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc154Q6RUT8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc154Q6RUT8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc154Q6RUT8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc154Q6RUT8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc154Q6RUT8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc154Q6RUT8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc154Q6RUT8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc154Q6RUT8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc154Q6RUT8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc154Q6RUT8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc154Q6RUT8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc154Q6RUT8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc154Q6RUT8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc154Q6RUT8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc154Q6RUT8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc154Q6RUT8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc154Q6RUT8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc154Q6RUT8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc154Q6RUT8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc154Q6RUT8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc154Q6RUT8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc154Q6RUT8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc154Q6RUT8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc154Q6RUT8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc154Q6RUT8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc154Q6RUT8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc154Q6RUT8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc154Q6RUT8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc154Q6RUT8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc154Q6RUT8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc154Q6RUT8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc154Q6RUT8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc154Q6RUT8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc154Q6RUT8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc154Q6RUT8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc154Q6RUT8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms