Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIE5

Atp1a2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a2Q6PIE5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Atp1a2Q6PIE5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Atp1a2Q6PIE5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Atp1a2Q6PIE5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Atp1a2Q6PIE5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Atp1a2Q6PIE5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Atp1a2Q6PIE5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
Atp1a2Q6PIE5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Atp1a2Q6PIE5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
Atp1a2Q6PIE5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Atp1a2Q6PIE5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,56
Atp1a2Q6PIE5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Atp1a2Q6PIE5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Atp1a2Q6PIE5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Atp1a2Q6PIE5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Atp1a2Q6PIE5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Atp1a2Q6PIE5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Atp1a2Q6PIE5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Atp1a2Q6PIE5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Atp1a2Q6PIE5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Atp1a2Q6PIE5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,74■■□□□ 1,55
Atp1a2Q6PIE5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Atp1a2Q6PIE5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24,74■■□□□ 1,55
Atp1a2Q6PIE5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Atp1a2Q6PIE5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Atp1a2Q6PIE5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Atp1a2Q6PIE5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Atp1a2Q6PIE5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Atp1a2Q6PIE5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Atp1a2Q6PIE5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,72■■□□□ 1,55
Atp1a2Q6PIE5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Atp1a2Q6PIE5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Atp1a2Q6PIE5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,55
Atp1a2Q6PIE5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,7■■□□□ 1,55
Atp1a2Q6PIE5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24,7■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24,7■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,65■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24,65■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24,64■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24,64■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Atp1a2Q6PIE5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Atp1a2Q6PIE5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Atp1a2Q6PIE5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24,63■■□□□ 1,53
Atp1a2Q6PIE5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Atp1a2Q6PIE5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Atp1a2Q6PIE5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Atp1a2Q6PIE5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Atp1a2Q6PIE5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Atp1a2Q6PIE5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Atp1a2Q6PIE5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Atp1a2Q6PIE5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Atp1a2Q6PIE5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Atp1a2Q6PIE5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Atp1a2Q6PIE5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Atp1a2Q6PIE5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Atp1a2Q6PIE5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Atp1a2Q6PIE5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Atp1a2Q6PIE5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Atp1a2Q6PIE5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24,59■■□□□ 1,53
Atp1a2Q6PIE5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Atp1a2Q6PIE5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,59■■□□□ 1,53
Atp1a2Q6PIE5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Atp1a2Q6PIE5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Atp1a2Q6PIE5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Atp1a2Q6PIE5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Atp1a2Q6PIE5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,58■■□□□ 1,53
Atp1a2Q6PIE5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24,58■■□□□ 1,53
Atp1a2Q6PIE5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,52
Atp1a2Q6PIE5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,58■■□□□ 1,52
Atp1a2Q6PIE5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49,1 ms