Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmeff1Q6PFE7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmeff1Q6PFE7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmeff1Q6PFE7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmeff1Q6PFE7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmeff1Q6PFE7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmeff1Q6PFE7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmeff1Q6PFE7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmeff1Q6PFE7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmeff1Q6PFE7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmeff1Q6PFE7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmeff1Q6PFE7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmeff1Q6PFE7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmeff1Q6PFE7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmeff1Q6PFE7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmeff1Q6PFE7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmeff1Q6PFE7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmeff1Q6PFE7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmeff1Q6PFE7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmeff1Q6PFE7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmeff1Q6PFE7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmeff1Q6PFE7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmeff1Q6PFE7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmeff1Q6PFE7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmeff1Q6PFE7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmeff1Q6PFE7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmeff1Q6PFE7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmeff1Q6PFE7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmeff1Q6PFE7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmeff1Q6PFE7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmeff1Q6PFE7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmeff1Q6PFE7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmeff1Q6PFE7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmeff1Q6PFE7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmeff1Q6PFE7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmeff1Q6PFE7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmeff1Q6PFE7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmeff1Q6PFE7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmeff1Q6PFE7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmeff1Q6PFE7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmeff1Q6PFE7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmeff1Q6PFE7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmeff1Q6PFE7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmeff1Q6PFE7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmeff1Q6PFE7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmeff1Q6PFE7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmeff1Q6PFE7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmeff1Q6PFE7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmeff1Q6PFE7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmeff1Q6PFE7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmeff1Q6PFE7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmeff1Q6PFE7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmeff1Q6PFE7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmeff1Q6PFE7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmeff1Q6PFE7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmeff1Q6PFE7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmeff1Q6PFE7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmeff1Q6PFE7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmeff1Q6PFE7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmeff1Q6PFE7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmeff1Q6PFE7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmeff1Q6PFE7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmeff1Q6PFE7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmeff1Q6PFE7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmeff1Q6PFE7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmeff1Q6PFE7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmeff1Q6PFE7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmeff1Q6PFE7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmeff1Q6PFE7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmeff1Q6PFE7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmeff1Q6PFE7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmeff1Q6PFE7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmeff1Q6PFE7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmeff1Q6PFE7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmeff1Q6PFE7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmeff1Q6PFE7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmeff1Q6PFE7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmeff1Q6PFE7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmeff1Q6PFE7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmeff1Q6PFE7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmeff1Q6PFE7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmeff1Q6PFE7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmeff1Q6PFE7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmeff1Q6PFE7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmeff1Q6PFE7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmeff1Q6PFE7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmeff1Q6PFE7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmeff1Q6PFE7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmeff1Q6PFE7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmeff1Q6PFE7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms