Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RgmaQ6PCX7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RgmaQ6PCX7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RgmaQ6PCX7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RgmaQ6PCX7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RgmaQ6PCX7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RgmaQ6PCX7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RgmaQ6PCX7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RgmaQ6PCX7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RgmaQ6PCX7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RgmaQ6PCX7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RgmaQ6PCX7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RgmaQ6PCX7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RgmaQ6PCX7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RgmaQ6PCX7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RgmaQ6PCX7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RgmaQ6PCX7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RgmaQ6PCX7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RgmaQ6PCX7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RgmaQ6PCX7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RgmaQ6PCX7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RgmaQ6PCX7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RgmaQ6PCX7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RgmaQ6PCX7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RgmaQ6PCX7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RgmaQ6PCX7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RgmaQ6PCX7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RgmaQ6PCX7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RgmaQ6PCX7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RgmaQ6PCX7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RgmaQ6PCX7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RgmaQ6PCX7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RgmaQ6PCX7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RgmaQ6PCX7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RgmaQ6PCX7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RgmaQ6PCX7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RgmaQ6PCX7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RgmaQ6PCX7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RgmaQ6PCX7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RgmaQ6PCX7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RgmaQ6PCX7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RgmaQ6PCX7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RgmaQ6PCX7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RgmaQ6PCX7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RgmaQ6PCX7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RgmaQ6PCX7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RgmaQ6PCX7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RgmaQ6PCX7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RgmaQ6PCX7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RgmaQ6PCX7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RgmaQ6PCX7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RgmaQ6PCX7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RgmaQ6PCX7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RgmaQ6PCX7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RgmaQ6PCX7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RgmaQ6PCX7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RgmaQ6PCX7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RgmaQ6PCX7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RgmaQ6PCX7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RgmaQ6PCX7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RgmaQ6PCX7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RgmaQ6PCX7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RgmaQ6PCX7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RgmaQ6PCX7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RgmaQ6PCX7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RgmaQ6PCX7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RgmaQ6PCX7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RgmaQ6PCX7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RgmaQ6PCX7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RgmaQ6PCX7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RgmaQ6PCX7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RgmaQ6PCX7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1286.1 ms