Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Herc4Q6PAV2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Herc4Q6PAV2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Herc4Q6PAV2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Herc4Q6PAV2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Herc4Q6PAV2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Herc4Q6PAV2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Herc4Q6PAV2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Herc4Q6PAV2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Herc4Q6PAV2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Herc4Q6PAV2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Herc4Q6PAV2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Herc4Q6PAV2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Herc4Q6PAV2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Herc4Q6PAV2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Herc4Q6PAV2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Herc4Q6PAV2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Herc4Q6PAV2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Herc4Q6PAV2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Herc4Q6PAV2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Herc4Q6PAV2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Herc4Q6PAV2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Herc4Q6PAV2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Herc4Q6PAV2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Herc4Q6PAV2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Herc4Q6PAV2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Herc4Q6PAV2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Herc4Q6PAV2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Herc4Q6PAV2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Herc4Q6PAV2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Herc4Q6PAV2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Herc4Q6PAV2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Herc4Q6PAV2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Herc4Q6PAV2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Herc4Q6PAV2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Herc4Q6PAV2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Herc4Q6PAV2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Herc4Q6PAV2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Herc4Q6PAV2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Herc4Q6PAV2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Herc4Q6PAV2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Herc4Q6PAV2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Herc4Q6PAV2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Herc4Q6PAV2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Herc4Q6PAV2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Herc4Q6PAV2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Herc4Q6PAV2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Herc4Q6PAV2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Herc4Q6PAV2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Herc4Q6PAV2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Herc4Q6PAV2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Herc4Q6PAV2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Herc4Q6PAV2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Herc4Q6PAV2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Herc4Q6PAV2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Herc4Q6PAV2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Herc4Q6PAV2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Herc4Q6PAV2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Herc4Q6PAV2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Herc4Q6PAV2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Herc4Q6PAV2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Herc4Q6PAV2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Herc4Q6PAV2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Herc4Q6PAV2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Herc4Q6PAV2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Herc4Q6PAV2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Herc4Q6PAV2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Herc4Q6PAV2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Herc4Q6PAV2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Herc4Q6PAV2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Herc4Q6PAV2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Herc4Q6PAV2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Herc4Q6PAV2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Herc4Q6PAV2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Herc4Q6PAV2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Herc4Q6PAV2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Herc4Q6PAV2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Herc4Q6PAV2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Herc4Q6PAV2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Herc4Q6PAV2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Herc4Q6PAV2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Herc4Q6PAV2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Herc4Q6PAV2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Herc4Q6PAV2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Herc4Q6PAV2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Herc4Q6PAV2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Herc4Q6PAV2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Herc4Q6PAV2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Herc4Q6PAV2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Herc4Q6PAV2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Herc4Q6PAV2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Herc4Q6PAV2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Herc4Q6PAV2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Herc4Q6PAV2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Herc4Q6PAV2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Herc4Q6PAV2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Herc4Q6PAV2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Herc4Q6PAV2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Herc4Q6PAV2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Herc4Q6PAV2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms