Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTA4

Rragb, Ras-related GTP-binding protein B, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RragbQ6NTA4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RragbQ6NTA4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RragbQ6NTA4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RragbQ6NTA4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RragbQ6NTA4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RragbQ6NTA4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RragbQ6NTA4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RragbQ6NTA4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RragbQ6NTA4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RragbQ6NTA4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RragbQ6NTA4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RragbQ6NTA4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RragbQ6NTA4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RragbQ6NTA4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RragbQ6NTA4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RragbQ6NTA4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RragbQ6NTA4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RragbQ6NTA4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RragbQ6NTA4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RragbQ6NTA4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RragbQ6NTA4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RragbQ6NTA4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RragbQ6NTA4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RragbQ6NTA4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RragbQ6NTA4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RragbQ6NTA4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RragbQ6NTA4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RragbQ6NTA4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RragbQ6NTA4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RragbQ6NTA4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RragbQ6NTA4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RragbQ6NTA4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RragbQ6NTA4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RragbQ6NTA4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RragbQ6NTA4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RragbQ6NTA4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RragbQ6NTA4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RragbQ6NTA4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RragbQ6NTA4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RragbQ6NTA4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RragbQ6NTA4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RragbQ6NTA4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RragbQ6NTA4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RragbQ6NTA4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RragbQ6NTA4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
RragbQ6NTA4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RragbQ6NTA4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RragbQ6NTA4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RragbQ6NTA4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RragbQ6NTA4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RragbQ6NTA4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RragbQ6NTA4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RragbQ6NTA4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RragbQ6NTA4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RragbQ6NTA4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RragbQ6NTA4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RragbQ6NTA4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RragbQ6NTA4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RragbQ6NTA4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RragbQ6NTA4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RragbQ6NTA4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RragbQ6NTA4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RragbQ6NTA4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RragbQ6NTA4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RragbQ6NTA4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RragbQ6NTA4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RragbQ6NTA4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RragbQ6NTA4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RragbQ6NTA4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RragbQ6NTA4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RragbQ6NTA4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RragbQ6NTA4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RragbQ6NTA4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RragbQ6NTA4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RragbQ6NTA4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RragbQ6NTA4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RragbQ6NTA4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RragbQ6NTA4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RragbQ6NTA4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RragbQ6NTA4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RragbQ6NTA4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RragbQ6NTA4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RragbQ6NTA4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RragbQ6NTA4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RragbQ6NTA4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RragbQ6NTA4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RragbQ6NTA4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RragbQ6NTA4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RragbQ6NTA4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RragbQ6NTA4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RragbQ6NTA4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RragbQ6NTA4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RragbQ6NTA4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RragbQ6NTA4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RragbQ6NTA4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RragbQ6NTA4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RragbQ6NTA4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RragbQ6NTA4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RragbQ6NTA4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RragbQ6NTA4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms