Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5416Q6IE28 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5416Q6IE28 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5416Q6IE28 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5416Q6IE28 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5416Q6IE28 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5416Q6IE28 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5416Q6IE28 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5416Q6IE28 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5416Q6IE28 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5416Q6IE28 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5416Q6IE28 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5416Q6IE28 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5416Q6IE28 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5416Q6IE28 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5416Q6IE28 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5416Q6IE28 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5416Q6IE28 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5416Q6IE28 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5416Q6IE28 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5416Q6IE28 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5416Q6IE28 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5416Q6IE28 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5416Q6IE28 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5416Q6IE28 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5416Q6IE28 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5416Q6IE28 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5416Q6IE28 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5416Q6IE28 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5416Q6IE28 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5416Q6IE28 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5416Q6IE28 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5416Q6IE28 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5416Q6IE28 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5416Q6IE28 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5416Q6IE28 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5416Q6IE28 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5416Q6IE28 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5416Q6IE28 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5416Q6IE28 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5416Q6IE28 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5416Q6IE28 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5416Q6IE28 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5416Q6IE28 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5416Q6IE28 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5416Q6IE28 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5416Q6IE28 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5416Q6IE28 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5416Q6IE28 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5416Q6IE28 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5416Q6IE28 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5416Q6IE28 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5416Q6IE28 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5416Q6IE28 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5416Q6IE28 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5416Q6IE28 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5416Q6IE28 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5416Q6IE28 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5416Q6IE28 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5416Q6IE28 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5416Q6IE28 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5416Q6IE28 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5416Q6IE28 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5416Q6IE28 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5416Q6IE28 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5416Q6IE28 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5416Q6IE28 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5416Q6IE28 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5416Q6IE28 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5416Q6IE28 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5416Q6IE28 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5416Q6IE28 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5416Q6IE28 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5416Q6IE28 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5416Q6IE28 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5416Q6IE28 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5416Q6IE28 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5416Q6IE28 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5416Q6IE28 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5416Q6IE28 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5416Q6IE28 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5416Q6IE28 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5416Q6IE28 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm5416Q6IE28 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5416Q6IE28 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5416Q6IE28 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5416Q6IE28 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5416Q6IE28 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5416Q6IE28 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm5416Q6IE28 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5416Q6IE28 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5416Q6IE28 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5416Q6IE28 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5416Q6IE28 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5416Q6IE28 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5416Q6IE28 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5416Q6IE28 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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