Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fndc3c1Q6DFV6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Fndc3c1Q6DFV6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Fndc3c1Q6DFV6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fndc3c1Q6DFV6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fndc3c1Q6DFV6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fndc3c1Q6DFV6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fndc3c1Q6DFV6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fndc3c1Q6DFV6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fndc3c1Q6DFV6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fndc3c1Q6DFV6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fndc3c1Q6DFV6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fndc3c1Q6DFV6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fndc3c1Q6DFV6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fndc3c1Q6DFV6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fndc3c1Q6DFV6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Fndc3c1Q6DFV6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fndc3c1Q6DFV6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fndc3c1Q6DFV6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fndc3c1Q6DFV6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fndc3c1Q6DFV6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fndc3c1Q6DFV6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fndc3c1Q6DFV6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Fndc3c1Q6DFV6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fndc3c1Q6DFV6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fndc3c1Q6DFV6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fndc3c1Q6DFV6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fndc3c1Q6DFV6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fndc3c1Q6DFV6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fndc3c1Q6DFV6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fndc3c1Q6DFV6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fndc3c1Q6DFV6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fndc3c1Q6DFV6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fndc3c1Q6DFV6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fndc3c1Q6DFV6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Fndc3c1Q6DFV6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fndc3c1Q6DFV6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Fndc3c1Q6DFV6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fndc3c1Q6DFV6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fndc3c1Q6DFV6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fndc3c1Q6DFV6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fndc3c1Q6DFV6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fndc3c1Q6DFV6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fndc3c1Q6DFV6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fndc3c1Q6DFV6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fndc3c1Q6DFV6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fndc3c1Q6DFV6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Fndc3c1Q6DFV6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fndc3c1Q6DFV6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fndc3c1Q6DFV6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fndc3c1Q6DFV6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fndc3c1Q6DFV6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Fndc3c1Q6DFV6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fndc3c1Q6DFV6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fndc3c1Q6DFV6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fndc3c1Q6DFV6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fndc3c1Q6DFV6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fndc3c1Q6DFV6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fndc3c1Q6DFV6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Fndc3c1Q6DFV6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fndc3c1Q6DFV6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fndc3c1Q6DFV6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Fndc3c1Q6DFV6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fndc3c1Q6DFV6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fndc3c1Q6DFV6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Fndc3c1Q6DFV6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fndc3c1Q6DFV6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fndc3c1Q6DFV6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fndc3c1Q6DFV6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fndc3c1Q6DFV6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fndc3c1Q6DFV6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fndc3c1Q6DFV6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fndc3c1Q6DFV6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fndc3c1Q6DFV6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fndc3c1Q6DFV6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fndc3c1Q6DFV6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fndc3c1Q6DFV6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Fndc3c1Q6DFV6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fndc3c1Q6DFV6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fndc3c1Q6DFV6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fndc3c1Q6DFV6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fndc3c1Q6DFV6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fndc3c1Q6DFV6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fndc3c1Q6DFV6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fndc3c1Q6DFV6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fndc3c1Q6DFV6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fndc3c1Q6DFV6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms