Protein–RNA interactions for Protein: Q68G58

Apex2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex2Q68G58 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apex2Q68G58 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apex2Q68G58 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apex2Q68G58 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apex2Q68G58 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apex2Q68G58 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apex2Q68G58 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apex2Q68G58 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Apex2Q68G58 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apex2Q68G58 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apex2Q68G58 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms