Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ctnna3Q65CL1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ctnna3Q65CL1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ctnna3Q65CL1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ctnna3Q65CL1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ctnna3Q65CL1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ctnna3Q65CL1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ctnna3Q65CL1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ctnna3Q65CL1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ctnna3Q65CL1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ctnna3Q65CL1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ctnna3Q65CL1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ctnna3Q65CL1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ctnna3Q65CL1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ctnna3Q65CL1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ctnna3Q65CL1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ctnna3Q65CL1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctnna3Q65CL1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctnna3Q65CL1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctnna3Q65CL1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctnna3Q65CL1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctnna3Q65CL1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctnna3Q65CL1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctnna3Q65CL1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctnna3Q65CL1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctnna3Q65CL1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctnna3Q65CL1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctnna3Q65CL1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctnna3Q65CL1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctnna3Q65CL1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctnna3Q65CL1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ctnna3Q65CL1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ctnna3Q65CL1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ctnna3Q65CL1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ctnna3Q65CL1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ctnna3Q65CL1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctnna3Q65CL1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctnna3Q65CL1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctnna3Q65CL1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ctnna3Q65CL1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ctnna3Q65CL1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ctnna3Q65CL1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ctnna3Q65CL1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ctnna3Q65CL1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ctnna3Q65CL1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ctnna3Q65CL1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ctnna3Q65CL1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ctnna3Q65CL1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ctnna3Q65CL1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctnna3Q65CL1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctnna3Q65CL1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctnna3Q65CL1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctnna3Q65CL1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctnna3Q65CL1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctnna3Q65CL1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctnna3Q65CL1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctnna3Q65CL1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctnna3Q65CL1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctnna3Q65CL1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctnna3Q65CL1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctnna3Q65CL1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctnna3Q65CL1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctnna3Q65CL1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctnna3Q65CL1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctnna3Q65CL1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctnna3Q65CL1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctnna3Q65CL1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ctnna3Q65CL1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctnna3Q65CL1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctnna3Q65CL1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctnna3Q65CL1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctnna3Q65CL1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctnna3Q65CL1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctnna3Q65CL1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctnna3Q65CL1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctnna3Q65CL1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctnna3Q65CL1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctnna3Q65CL1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctnna3Q65CL1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctnna3Q65CL1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctnna3Q65CL1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctnna3Q65CL1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctnna3Q65CL1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ctnna3Q65CL1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ctnna3Q65CL1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ctnna3Q65CL1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ctnna3Q65CL1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ctnna3Q65CL1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ctnna3Q65CL1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctnna3Q65CL1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctnna3Q65CL1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ctnna3Q65CL1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ctnna3Q65CL1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ctnna3Q65CL1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctnna3Q65CL1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ctnna3Q65CL1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ctnna3Q65CL1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctnna3Q65CL1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctnna3Q65CL1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms