Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2kQ63871 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Polr2kQ63871 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms