Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift52Q62559 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift52Q62559 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift52Q62559 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ift52Q62559 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ift52Q62559 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ift52Q62559 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ift52Q62559 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ift52Q62559 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ift52Q62559 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift52Q62559 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift52Q62559 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift52Q62559 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift52Q62559 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift52Q62559 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ift52Q62559 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift52Q62559 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift52Q62559 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift52Q62559 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ift52Q62559 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ift52Q62559 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ift52Q62559 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ift52Q62559 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ift52Q62559 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift52Q62559 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift52Q62559 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift52Q62559 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift52Q62559 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift52Q62559 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift52Q62559 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift52Q62559 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift52Q62559 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ift52Q62559 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ift52Q62559 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ift52Q62559 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ift52Q62559 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ift52Q62559 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ift52Q62559 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ift52Q62559 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ift52Q62559 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift52Q62559 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift52Q62559 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift52Q62559 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift52Q62559 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ift52Q62559 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ift52Q62559 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ift52Q62559 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ift52Q62559 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ift52Q62559 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift52Q62559 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift52Q62559 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift52Q62559 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift52Q62559 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift52Q62559 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift52Q62559 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ift52Q62559 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ift52Q62559 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ift52Q62559 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ift52Q62559 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ift52Q62559 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ift52Q62559 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ift52Q62559 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ift52Q62559 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ift52Q62559 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ift52Q62559 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ift52Q62559 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ift52Q62559 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ift52Q62559 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ift52Q62559 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ift52Q62559 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift52Q62559 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift52Q62559 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms