Protein–RNA interactions for Protein: Q62247

Sox16, Protein SOX-16 (Fragment), mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox16Q62247 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC13,51□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,51□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC13,51□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13,51□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13,51□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,51□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,51□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,51□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,51□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,5□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,5□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC13,5□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,5□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC13,49□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,49□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,49□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,49□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,48□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC13,48□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC13,48□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,48□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13,48□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13,48□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,47□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,47□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13,47□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,47□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,47□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,47□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC13,47□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,47□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,46□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC13,46□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,46□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,46□□□□□ -0,25
Sox16Q62247 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,46□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,46□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC13,46□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,45□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC13,45□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,45□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,45□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13,45□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC13,45□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,45□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC13,45□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13,44□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,44□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,44□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13,44□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,43□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,43□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,43□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,43□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,43□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,43□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,43□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13,43□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,42□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,42□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,42□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC13,42□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,42□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,41□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,41□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC13,41□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13,41□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13,41□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,41□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,41□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,4□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13,4□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,4□□□□□ -0,26
Sox16Q62247 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13,39□□□□□ -0,27
Sox16Q62247 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,39□□□□□ -0,27
Sox16Q62247 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,39□□□□□ -0,27
Sox16Q62247 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13,39□□□□□ -0,27
Sox16Q62247 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13,39□□□□□ -0,27
Sox16Q62247 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13,39□□□□□ -0,27
Sox16Q62247 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,39□□□□□ -0,27
Sox16Q62247 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,39□□□□□ -0,27
Sox16Q62247 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,39□□□□□ -0,27
Sox16Q62247 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,39□□□□□ -0,27
Sox16Q62247 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,39□□□□□ -0,27
Sox16Q62247 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13,39□□□□□ -0,27
Sox16Q62247 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13,38□□□□□ -0,27
Sox16Q62247 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,38□□□□□ -0,27
Sox16Q62247 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC13,38□□□□□ -0,27
Sox16Q62247 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,37□□□□□ -0,27
Sox16Q62247 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,37□□□□□ -0,27
Sox16Q62247 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,37□□□□□ -0,27
Sox16Q62247 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,37□□□□□ -0,27
Sox16Q62247 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,36□□□□□ -0,27
Sox16Q62247 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,36□□□□□ -0,27
Sox16Q62247 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,36□□□□□ -0,27
Sox16Q62247 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,36□□□□□ -0,27
Sox16Q62247 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,36□□□□□ -0,27
Sox16Q62247 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC13,36□□□□□ -0,27
Sox16Q62247 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,36□□□□□ -0,27
Sox16Q62247 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,35□□□□□ -0,27
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