Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttf1Q62187 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttf1Q62187 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttf1Q62187 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttf1Q62187 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttf1Q62187 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttf1Q62187 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttf1Q62187 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttf1Q62187 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttf1Q62187 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttf1Q62187 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttf1Q62187 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttf1Q62187 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttf1Q62187 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttf1Q62187 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttf1Q62187 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttf1Q62187 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttf1Q62187 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttf1Q62187 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttf1Q62187 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttf1Q62187 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttf1Q62187 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttf1Q62187 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttf1Q62187 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttf1Q62187 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttf1Q62187 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttf1Q62187 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttf1Q62187 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttf1Q62187 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttf1Q62187 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttf1Q62187 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttf1Q62187 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttf1Q62187 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttf1Q62187 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Ttf1Q62187 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttf1Q62187 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttf1Q62187 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttf1Q62187 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttf1Q62187 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttf1Q62187 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttf1Q62187 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttf1Q62187 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttf1Q62187 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttf1Q62187 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttf1Q62187 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttf1Q62187 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttf1Q62187 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttf1Q62187 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttf1Q62187 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttf1Q62187 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttf1Q62187 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttf1Q62187 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttf1Q62187 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttf1Q62187 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttf1Q62187 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttf1Q62187 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttf1Q62187 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttf1Q62187 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttf1Q62187 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttf1Q62187 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttf1Q62187 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttf1Q62187 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttf1Q62187 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttf1Q62187 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttf1Q62187 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttf1Q62187 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttf1Q62187 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttf1Q62187 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttf1Q62187 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttf1Q62187 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttf1Q62187 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttf1Q62187 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttf1Q62187 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttf1Q62187 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttf1Q62187 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttf1Q62187 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttf1Q62187 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttf1Q62187 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttf1Q62187 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttf1Q62187 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttf1Q62187 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttf1Q62187 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttf1Q62187 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttf1Q62187 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttf1Q62187 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttf1Q62187 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttf1Q62187 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttf1Q62187 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttf1Q62187 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttf1Q62187 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttf1Q62187 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttf1Q62187 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttf1Q62187 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttf1Q62187 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttf1Q62187 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttf1Q62187 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttf1Q62187 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttf1Q62187 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttf1Q62187 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttf1Q62187 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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