Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phox2aQ62066 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Phox2aQ62066 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phox2aQ62066 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phox2aQ62066 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phox2aQ62066 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phox2aQ62066 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phox2aQ62066 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phox2aQ62066 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phox2aQ62066 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phox2aQ62066 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phox2aQ62066 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phox2aQ62066 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phox2aQ62066 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 302.2 ms