Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AtrxQ61687 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AtrxQ61687 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AtrxQ61687 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AtrxQ61687 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AtrxQ61687 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AtrxQ61687 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AtrxQ61687 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AtrxQ61687 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AtrxQ61687 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AtrxQ61687 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AtrxQ61687 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AtrxQ61687 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AtrxQ61687 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AtrxQ61687 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AtrxQ61687 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AtrxQ61687 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AtrxQ61687 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
AtrxQ61687 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
AtrxQ61687 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AtrxQ61687 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AtrxQ61687 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AtrxQ61687 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AtrxQ61687 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AtrxQ61687 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtrxQ61687 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtrxQ61687 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AtrxQ61687 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtrxQ61687 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtrxQ61687 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtrxQ61687 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtrxQ61687 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtrxQ61687 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtrxQ61687 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AtrxQ61687 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AtrxQ61687 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AtrxQ61687 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AtrxQ61687 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AtrxQ61687 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AtrxQ61687 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AtrxQ61687 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AtrxQ61687 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AtrxQ61687 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AtrxQ61687 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
AtrxQ61687 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
AtrxQ61687 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AtrxQ61687 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AtrxQ61687 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AtrxQ61687 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AtrxQ61687 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AtrxQ61687 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
AtrxQ61687 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AtrxQ61687 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AtrxQ61687 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AtrxQ61687 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AtrxQ61687 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AtrxQ61687 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AtrxQ61687 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AtrxQ61687 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AtrxQ61687 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AtrxQ61687 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AtrxQ61687 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AtrxQ61687 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AtrxQ61687 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AtrxQ61687 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AtrxQ61687 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AtrxQ61687 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AtrxQ61687 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AtrxQ61687 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AtrxQ61687 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AtrxQ61687 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AtrxQ61687 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
AtrxQ61687 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AtrxQ61687 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AtrxQ61687 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AtrxQ61687 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
AtrxQ61687 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AtrxQ61687 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
AtrxQ61687 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AtrxQ61687 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AtrxQ61687 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AtrxQ61687 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AtrxQ61687 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AtrxQ61687 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AtrxQ61687 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AtrxQ61687 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AtrxQ61687 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AtrxQ61687 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AtrxQ61687 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AtrxQ61687 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AtrxQ61687 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AtrxQ61687 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AtrxQ61687 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AtrxQ61687 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
AtrxQ61687 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AtrxQ61687 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AtrxQ61687 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AtrxQ61687 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AtrxQ61687 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AtrxQ61687 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms