Protein–RNA interactions for Protein: Q61458

Ccnh, Cyclin-H, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnhQ61458 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CcnhQ61458 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CcnhQ61458 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CcnhQ61458 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CcnhQ61458 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CcnhQ61458 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CcnhQ61458 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CcnhQ61458 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CcnhQ61458 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CcnhQ61458 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CcnhQ61458 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CcnhQ61458 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CcnhQ61458 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CcnhQ61458 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CcnhQ61458 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CcnhQ61458 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CcnhQ61458 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CcnhQ61458 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CcnhQ61458 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CcnhQ61458 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CcnhQ61458 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CcnhQ61458 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CcnhQ61458 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CcnhQ61458 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CcnhQ61458 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CcnhQ61458 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CcnhQ61458 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CcnhQ61458 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CcnhQ61458 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CcnhQ61458 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CcnhQ61458 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CcnhQ61458 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CcnhQ61458 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CcnhQ61458 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CcnhQ61458 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CcnhQ61458 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CcnhQ61458 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CcnhQ61458 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CcnhQ61458 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CcnhQ61458 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CcnhQ61458 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CcnhQ61458 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CcnhQ61458 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CcnhQ61458 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CcnhQ61458 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CcnhQ61458 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CcnhQ61458 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CcnhQ61458 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CcnhQ61458 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CcnhQ61458 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CcnhQ61458 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CcnhQ61458 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcnhQ61458 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcnhQ61458 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CcnhQ61458 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcnhQ61458 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcnhQ61458 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcnhQ61458 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CcnhQ61458 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CcnhQ61458 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CcnhQ61458 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CcnhQ61458 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CcnhQ61458 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CcnhQ61458 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CcnhQ61458 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CcnhQ61458 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CcnhQ61458 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CcnhQ61458 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CcnhQ61458 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CcnhQ61458 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CcnhQ61458 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms