Protein–RNA interactions for Protein: Q61425

Hadh, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HadhQ61425 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HadhQ61425 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HadhQ61425 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HadhQ61425 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HadhQ61425 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HadhQ61425 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HadhQ61425 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HadhQ61425 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HadhQ61425 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HadhQ61425 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HadhQ61425 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HadhQ61425 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HadhQ61425 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HadhQ61425 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HadhQ61425 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HadhQ61425 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HadhQ61425 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HadhQ61425 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HadhQ61425 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HadhQ61425 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HadhQ61425 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HadhQ61425 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HadhQ61425 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HadhQ61425 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HadhQ61425 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HadhQ61425 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HadhQ61425 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HadhQ61425 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HadhQ61425 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HadhQ61425 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HadhQ61425 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HadhQ61425 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HadhQ61425 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HadhQ61425 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HadhQ61425 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HadhQ61425 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HadhQ61425 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HadhQ61425 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HadhQ61425 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HadhQ61425 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HadhQ61425 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HadhQ61425 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HadhQ61425 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HadhQ61425 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HadhQ61425 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HadhQ61425 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HadhQ61425 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HadhQ61425 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HadhQ61425 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HadhQ61425 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HadhQ61425 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HadhQ61425 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HadhQ61425 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HadhQ61425 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HadhQ61425 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HadhQ61425 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HadhQ61425 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HadhQ61425 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HadhQ61425 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HadhQ61425 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HadhQ61425 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HadhQ61425 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HadhQ61425 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HadhQ61425 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HadhQ61425 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HadhQ61425 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HadhQ61425 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HadhQ61425 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HadhQ61425 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HadhQ61425 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HadhQ61425 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HadhQ61425 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HadhQ61425 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HadhQ61425 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HadhQ61425 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HadhQ61425 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HadhQ61425 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HadhQ61425 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HadhQ61425 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HadhQ61425 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HadhQ61425 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HadhQ61425 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HadhQ61425 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HadhQ61425 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HadhQ61425 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HadhQ61425 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HadhQ61425 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HadhQ61425 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HadhQ61425 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HadhQ61425 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HadhQ61425 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HadhQ61425 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HadhQ61425 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HadhQ61425 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HadhQ61425 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HadhQ61425 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HadhQ61425 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HadhQ61425 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HadhQ61425 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HadhQ61425 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms