Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Foxd1Q61345 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Foxd1Q61345 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Foxd1Q61345 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Foxd1Q61345 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Foxd1Q61345 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Foxd1Q61345 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Foxd1Q61345 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Foxd1Q61345 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Foxd1Q61345 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Foxd1Q61345 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Foxd1Q61345 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Foxd1Q61345 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Foxd1Q61345 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Foxd1Q61345 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Foxd1Q61345 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Foxd1Q61345 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Foxd1Q61345 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Foxd1Q61345 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Foxd1Q61345 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Foxd1Q61345 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Foxd1Q61345 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Foxd1Q61345 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Foxd1Q61345 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Foxd1Q61345 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Foxd1Q61345 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Foxd1Q61345 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Foxd1Q61345 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Foxd1Q61345 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Foxd1Q61345 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Foxd1Q61345 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Foxd1Q61345 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Foxd1Q61345 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Foxd1Q61345 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Foxd1Q61345 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Foxd1Q61345 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Foxd1Q61345 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Foxd1Q61345 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Foxd1Q61345 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Foxd1Q61345 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Foxd1Q61345 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Foxd1Q61345 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Foxd1Q61345 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Foxd1Q61345 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Foxd1Q61345 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Foxd1Q61345 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Foxd1Q61345 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Foxd1Q61345 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Foxd1Q61345 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Foxd1Q61345 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Foxd1Q61345 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Foxd1Q61345 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Foxd1Q61345 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Foxd1Q61345 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Foxd1Q61345 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Foxd1Q61345 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Foxd1Q61345 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Foxd1Q61345 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Foxd1Q61345 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Foxd1Q61345 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Foxd1Q61345 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Foxd1Q61345 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Foxd1Q61345 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Foxd1Q61345 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Foxd1Q61345 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Foxd1Q61345 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Foxd1Q61345 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Foxd1Q61345 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Foxd1Q61345 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Foxd1Q61345 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Foxd1Q61345 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Foxd1Q61345 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Foxd1Q61345 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Foxd1Q61345 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Foxd1Q61345 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Foxd1Q61345 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Foxd1Q61345 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Foxd1Q61345 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Foxd1Q61345 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Foxd1Q61345 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Foxd1Q61345 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Foxd1Q61345 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Foxd1Q61345 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Foxd1Q61345 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Foxd1Q61345 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Foxd1Q61345 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Foxd1Q61345 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Foxd1Q61345 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Foxd1Q61345 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Foxd1Q61345 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Foxd1Q61345 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Foxd1Q61345 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Foxd1Q61345 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Foxd1Q61345 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Foxd1Q61345 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Foxd1Q61345 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Foxd1Q61345 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Foxd1Q61345 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Foxd1Q61345 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Foxd1Q61345 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms