Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tbc1d1Q60949 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tbc1d1Q60949 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tbc1d1Q60949 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tbc1d1Q60949 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tbc1d1Q60949 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tbc1d1Q60949 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tbc1d1Q60949 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tbc1d1Q60949 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tbc1d1Q60949 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tbc1d1Q60949 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tbc1d1Q60949 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tbc1d1Q60949 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tbc1d1Q60949 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tbc1d1Q60949 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tbc1d1Q60949 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tbc1d1Q60949 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tbc1d1Q60949 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tbc1d1Q60949 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tbc1d1Q60949 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tbc1d1Q60949 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tbc1d1Q60949 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tbc1d1Q60949 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tbc1d1Q60949 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tbc1d1Q60949 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tbc1d1Q60949 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tbc1d1Q60949 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tbc1d1Q60949 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tbc1d1Q60949 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tbc1d1Q60949 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tbc1d1Q60949 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tbc1d1Q60949 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tbc1d1Q60949 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tbc1d1Q60949 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tbc1d1Q60949 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tbc1d1Q60949 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tbc1d1Q60949 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tbc1d1Q60949 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tbc1d1Q60949 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tbc1d1Q60949 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tbc1d1Q60949 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tbc1d1Q60949 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tbc1d1Q60949 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tbc1d1Q60949 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tbc1d1Q60949 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tbc1d1Q60949 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tbc1d1Q60949 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tbc1d1Q60949 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tbc1d1Q60949 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tbc1d1Q60949 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tbc1d1Q60949 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tbc1d1Q60949 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tbc1d1Q60949 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tbc1d1Q60949 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tbc1d1Q60949 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tbc1d1Q60949 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tbc1d1Q60949 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d1Q60949 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d1Q60949 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d1Q60949 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d1Q60949 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d1Q60949 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tbc1d1Q60949 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Tbc1d1Q60949 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tbc1d1Q60949 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tbc1d1Q60949 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tbc1d1Q60949 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tbc1d1Q60949 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tbc1d1Q60949 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tbc1d1Q60949 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tbc1d1Q60949 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tbc1d1Q60949 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tbc1d1Q60949 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tbc1d1Q60949 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tbc1d1Q60949 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tbc1d1Q60949 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tbc1d1Q60949 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tbc1d1Q60949 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tbc1d1Q60949 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tbc1d1Q60949 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tbc1d1Q60949 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tbc1d1Q60949 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tbc1d1Q60949 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tbc1d1Q60949 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d1Q60949 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d1Q60949 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d1Q60949 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d1Q60949 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d1Q60949 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tbc1d1Q60949 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tbc1d1Q60949 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tbc1d1Q60949 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d1Q60949 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d1Q60949 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d1Q60949 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d1Q60949 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d1Q60949 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d1Q60949 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d1Q60949 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d1Q60949 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms