Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PmelQ60696 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PmelQ60696 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PmelQ60696 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PmelQ60696 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PmelQ60696 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PmelQ60696 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PmelQ60696 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PmelQ60696 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PmelQ60696 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PmelQ60696 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PmelQ60696 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PmelQ60696 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PmelQ60696 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PmelQ60696 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PmelQ60696 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PmelQ60696 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PmelQ60696 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PmelQ60696 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PmelQ60696 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PmelQ60696 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PmelQ60696 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PmelQ60696 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PmelQ60696 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PmelQ60696 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PmelQ60696 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PmelQ60696 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PmelQ60696 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PmelQ60696 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PmelQ60696 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PmelQ60696 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PmelQ60696 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PmelQ60696 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PmelQ60696 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PmelQ60696 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PmelQ60696 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PmelQ60696 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PmelQ60696 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PmelQ60696 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PmelQ60696 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PmelQ60696 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PmelQ60696 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PmelQ60696 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PmelQ60696 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PmelQ60696 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PmelQ60696 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PmelQ60696 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PmelQ60696 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PmelQ60696 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PmelQ60696 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PmelQ60696 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PmelQ60696 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PmelQ60696 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PmelQ60696 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PmelQ60696 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PmelQ60696 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PmelQ60696 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PmelQ60696 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PmelQ60696 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PmelQ60696 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PmelQ60696 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PmelQ60696 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PmelQ60696 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PmelQ60696 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PmelQ60696 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PmelQ60696 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PmelQ60696 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PmelQ60696 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PmelQ60696 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PmelQ60696 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PmelQ60696 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PmelQ60696 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PmelQ60696 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PmelQ60696 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PmelQ60696 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PmelQ60696 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PmelQ60696 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PmelQ60696 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PmelQ60696 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PmelQ60696 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PmelQ60696 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PmelQ60696 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PmelQ60696 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PmelQ60696 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PmelQ60696 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PmelQ60696 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PmelQ60696 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PmelQ60696 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PmelQ60696 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PmelQ60696 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PmelQ60696 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PmelQ60696 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PmelQ60696 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PmelQ60696 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PmelQ60696 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PmelQ60696 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PmelQ60696 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PmelQ60696 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PmelQ60696 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PmelQ60696 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms