Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ItgaeQ60677 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ItgaeQ60677 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ItgaeQ60677 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ItgaeQ60677 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ItgaeQ60677 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ItgaeQ60677 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ItgaeQ60677 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ItgaeQ60677 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ItgaeQ60677 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ItgaeQ60677 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ItgaeQ60677 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ItgaeQ60677 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ItgaeQ60677 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ItgaeQ60677 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ItgaeQ60677 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ItgaeQ60677 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ItgaeQ60677 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ItgaeQ60677 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ItgaeQ60677 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ItgaeQ60677 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ItgaeQ60677 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ItgaeQ60677 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ItgaeQ60677 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ItgaeQ60677 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ItgaeQ60677 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ItgaeQ60677 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ItgaeQ60677 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ItgaeQ60677 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ItgaeQ60677 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ItgaeQ60677 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ItgaeQ60677 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ItgaeQ60677 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ItgaeQ60677 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ItgaeQ60677 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ItgaeQ60677 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ItgaeQ60677 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ItgaeQ60677 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ItgaeQ60677 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ItgaeQ60677 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ItgaeQ60677 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ItgaeQ60677 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ItgaeQ60677 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ItgaeQ60677 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ItgaeQ60677 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ItgaeQ60677 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ItgaeQ60677 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ItgaeQ60677 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ItgaeQ60677 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ItgaeQ60677 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ItgaeQ60677 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ItgaeQ60677 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ItgaeQ60677 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ItgaeQ60677 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ItgaeQ60677 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ItgaeQ60677 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ItgaeQ60677 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ItgaeQ60677 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ItgaeQ60677 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ItgaeQ60677 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ItgaeQ60677 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ItgaeQ60677 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ItgaeQ60677 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ItgaeQ60677 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ItgaeQ60677 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ItgaeQ60677 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ItgaeQ60677 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ItgaeQ60677 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ItgaeQ60677 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ItgaeQ60677 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ItgaeQ60677 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ItgaeQ60677 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ItgaeQ60677 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ItgaeQ60677 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ItgaeQ60677 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ItgaeQ60677 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ItgaeQ60677 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ItgaeQ60677 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ItgaeQ60677 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ItgaeQ60677 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ItgaeQ60677 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ItgaeQ60677 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ItgaeQ60677 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ItgaeQ60677 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ItgaeQ60677 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ItgaeQ60677 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ItgaeQ60677 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ItgaeQ60677 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ItgaeQ60677 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ItgaeQ60677 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ItgaeQ60677 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ItgaeQ60677 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ItgaeQ60677 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ItgaeQ60677 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ItgaeQ60677 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ItgaeQ60677 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ItgaeQ60677 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ItgaeQ60677 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ItgaeQ60677 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ItgaeQ60677 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms