Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprnQ60673 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprnQ60673 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprnQ60673 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprnQ60673 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprnQ60673 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprnQ60673 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprnQ60673 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprnQ60673 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprnQ60673 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprnQ60673 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprnQ60673 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprnQ60673 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprnQ60673 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprnQ60673 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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PtprnQ60673 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprnQ60673 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprnQ60673 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PtprnQ60673 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PtprnQ60673 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprnQ60673 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprnQ60673 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprnQ60673 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprnQ60673 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprnQ60673 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprnQ60673 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprnQ60673 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprnQ60673 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprnQ60673 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprnQ60673 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprnQ60673 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprnQ60673 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PtprnQ60673 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprnQ60673 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprnQ60673 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprnQ60673 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprnQ60673 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprnQ60673 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprnQ60673 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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PtprnQ60673 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprnQ60673 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprnQ60673 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprnQ60673 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprnQ60673 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprnQ60673 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprnQ60673 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprnQ60673 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprnQ60673 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprnQ60673 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprnQ60673 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprnQ60673 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtprnQ60673 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtprnQ60673 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprnQ60673 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprnQ60673 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprnQ60673 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprnQ60673 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprnQ60673 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprnQ60673 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprnQ60673 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprnQ60673 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprnQ60673 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprnQ60673 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprnQ60673 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprnQ60673 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprnQ60673 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprnQ60673 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprnQ60673 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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