Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r196Q5SVD5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r196Q5SVD5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r196Q5SVD5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r196Q5SVD5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r196Q5SVD5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r196Q5SVD5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r196Q5SVD5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r196Q5SVD5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r196Q5SVD5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r196Q5SVD5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r196Q5SVD5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r196Q5SVD5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r196Q5SVD5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r196Q5SVD5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r196Q5SVD5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r196Q5SVD5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vmn1r196Q5SVD5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r196Q5SVD5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r196Q5SVD5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r196Q5SVD5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r196Q5SVD5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r196Q5SVD5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r196Q5SVD5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r196Q5SVD5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r196Q5SVD5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r196Q5SVD5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r196Q5SVD5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r196Q5SVD5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r196Q5SVD5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r196Q5SVD5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r196Q5SVD5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r196Q5SVD5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r196Q5SVD5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r196Q5SVD5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vmn1r196Q5SVD5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r196Q5SVD5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r196Q5SVD5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r196Q5SVD5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r196Q5SVD5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r196Q5SVD5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r196Q5SVD5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r196Q5SVD5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r196Q5SVD5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r196Q5SVD5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r196Q5SVD5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r196Q5SVD5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r196Q5SVD5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r196Q5SVD5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r196Q5SVD5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r196Q5SVD5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r196Q5SVD5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r196Q5SVD5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r196Q5SVD5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r196Q5SVD5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r196Q5SVD5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r196Q5SVD5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r196Q5SVD5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r196Q5SVD5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r196Q5SVD5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r196Q5SVD5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r196Q5SVD5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r196Q5SVD5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r196Q5SVD5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r196Q5SVD5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r196Q5SVD5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r196Q5SVD5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r196Q5SVD5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r196Q5SVD5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r196Q5SVD5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r196Q5SVD5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r196Q5SVD5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r196Q5SVD5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r196Q5SVD5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r196Q5SVD5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r196Q5SVD5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r196Q5SVD5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r196Q5SVD5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn1r196Q5SVD5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn1r196Q5SVD5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn1r196Q5SVD5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn1r196Q5SVD5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn1r196Q5SVD5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn1r196Q5SVD5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn1r196Q5SVD5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms