Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctc1Q5SUQ9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctc1Q5SUQ9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctc1Q5SUQ9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctc1Q5SUQ9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctc1Q5SUQ9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctc1Q5SUQ9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctc1Q5SUQ9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctc1Q5SUQ9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctc1Q5SUQ9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctc1Q5SUQ9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctc1Q5SUQ9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctc1Q5SUQ9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctc1Q5SUQ9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctc1Q5SUQ9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctc1Q5SUQ9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctc1Q5SUQ9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctc1Q5SUQ9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctc1Q5SUQ9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctc1Q5SUQ9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctc1Q5SUQ9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctc1Q5SUQ9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctc1Q5SUQ9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctc1Q5SUQ9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctc1Q5SUQ9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctc1Q5SUQ9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctc1Q5SUQ9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctc1Q5SUQ9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctc1Q5SUQ9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctc1Q5SUQ9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctc1Q5SUQ9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctc1Q5SUQ9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctc1Q5SUQ9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctc1Q5SUQ9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctc1Q5SUQ9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctc1Q5SUQ9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctc1Q5SUQ9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctc1Q5SUQ9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctc1Q5SUQ9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctc1Q5SUQ9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ctc1Q5SUQ9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ctc1Q5SUQ9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ctc1Q5SUQ9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctc1Q5SUQ9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctc1Q5SUQ9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctc1Q5SUQ9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctc1Q5SUQ9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctc1Q5SUQ9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctc1Q5SUQ9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctc1Q5SUQ9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctc1Q5SUQ9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctc1Q5SUQ9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctc1Q5SUQ9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctc1Q5SUQ9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctc1Q5SUQ9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctc1Q5SUQ9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctc1Q5SUQ9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctc1Q5SUQ9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctc1Q5SUQ9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctc1Q5SUQ9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctc1Q5SUQ9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctc1Q5SUQ9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctc1Q5SUQ9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctc1Q5SUQ9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctc1Q5SUQ9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctc1Q5SUQ9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctc1Q5SUQ9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctc1Q5SUQ9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctc1Q5SUQ9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ctc1Q5SUQ9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctc1Q5SUQ9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctc1Q5SUQ9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctc1Q5SUQ9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctc1Q5SUQ9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctc1Q5SUQ9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctc1Q5SUQ9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctc1Q5SUQ9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctc1Q5SUQ9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctc1Q5SUQ9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctc1Q5SUQ9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctc1Q5SUQ9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctc1Q5SUQ9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctc1Q5SUQ9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctc1Q5SUQ9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctc1Q5SUQ9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctc1Q5SUQ9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctc1Q5SUQ9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctc1Q5SUQ9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctc1Q5SUQ9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctc1Q5SUQ9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctc1Q5SUQ9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctc1Q5SUQ9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctc1Q5SUQ9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctc1Q5SUQ9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctc1Q5SUQ9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctc1Q5SUQ9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctc1Q5SUQ9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctc1Q5SUQ9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctc1Q5SUQ9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctc1Q5SUQ9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms