Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf215Q5SPX3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf215Q5SPX3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf215Q5SPX3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf215Q5SPX3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf215Q5SPX3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf215Q5SPX3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf215Q5SPX3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf215Q5SPX3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf215Q5SPX3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf215Q5SPX3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf215Q5SPX3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf215Q5SPX3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf215Q5SPX3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf215Q5SPX3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf215Q5SPX3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf215Q5SPX3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rnf215Q5SPX3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf215Q5SPX3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf215Q5SPX3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf215Q5SPX3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf215Q5SPX3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf215Q5SPX3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf215Q5SPX3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf215Q5SPX3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf215Q5SPX3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf215Q5SPX3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf215Q5SPX3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf215Q5SPX3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf215Q5SPX3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf215Q5SPX3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf215Q5SPX3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf215Q5SPX3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf215Q5SPX3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf215Q5SPX3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf215Q5SPX3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf215Q5SPX3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf215Q5SPX3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf215Q5SPX3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf215Q5SPX3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf215Q5SPX3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf215Q5SPX3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf215Q5SPX3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf215Q5SPX3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf215Q5SPX3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf215Q5SPX3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf215Q5SPX3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf215Q5SPX3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf215Q5SPX3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf215Q5SPX3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf215Q5SPX3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf215Q5SPX3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf215Q5SPX3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf215Q5SPX3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf215Q5SPX3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf215Q5SPX3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf215Q5SPX3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf215Q5SPX3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf215Q5SPX3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf215Q5SPX3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf215Q5SPX3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf215Q5SPX3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf215Q5SPX3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf215Q5SPX3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf215Q5SPX3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf215Q5SPX3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf215Q5SPX3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf215Q5SPX3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf215Q5SPX3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf215Q5SPX3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf215Q5SPX3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf215Q5SPX3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf215Q5SPX3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf215Q5SPX3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf215Q5SPX3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf215Q5SPX3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf215Q5SPX3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf215Q5SPX3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf215Q5SPX3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf215Q5SPX3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf215Q5SPX3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf215Q5SPX3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf215Q5SPX3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf215Q5SPX3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf215Q5SPX3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf215Q5SPX3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf215Q5SPX3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf215Q5SPX3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf215Q5SPX3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf215Q5SPX3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf215Q5SPX3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf215Q5SPX3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf215Q5SPX3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf215Q5SPX3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf215Q5SPX3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf215Q5SPX3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf215Q5SPX3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf215Q5SPX3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf215Q5SPX3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf215Q5SPX3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms